基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2009年
6期
1043-1048
,共6页
杨杞%白肖飞%高阳%伊莉佳%丛靖宇%王瑞刚%李国婧
楊杞%白肖飛%高暘%伊莉佳%叢靖宇%王瑞剛%李國婧
양기%백초비%고양%이리가%총정우%왕서강%리국청
沙冬青%CBF/DREB1%RACE%序列分析
沙鼕青%CBF/DREB1%RACE%序列分析
사동청%CBF/DREB1%RACE%서렬분석
Ammopiptanthus mongolicus%CBF/DREB1%RACE%Sequence analysis
CBF/DREB1(C-repeat binding factor/dehydration resistance element binding protein 1)是一类抗逆相关的转录因子,它们的表达可以激活下游一系列抗逆应答基因的表达,从而提高植株的抗逆性.沙冬青(A mmopiptanthus mongolicus)主要生长在中国西北荒漠和半荒漠地带,是典型的旱生资源植物,具有突出的抗寒、抗旱、耐盐碱特性.本文以沙冬青为实验材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆了沙冬青CBF/DREB1基因cDNA序列,并对其进行了序列分析.结果表明:沙冬青CBF/DREB1转录因子基因序列全长为991 bp,包括624 bp的开放阅读框(ORF),起始密码子ATG,终止密码子TAA,114 bp的5UTR和253 bp的3UTR,以及加尾信号AATAAA及poly(A)_(11).生物信息学预测其演绎的氨基酸序列具有AP2结构域,且AP2结构域的两端拥有CBF家族特有的PKK/PPAGRxKFxETRHP和DSAWR两段短多肽序列,属于CBF家族.沙冬青CBF/DREB1转录因子的克隆为进一步研究植物抗逆和获得抗性基因提供了新的候选基因,也为进一步从分子水平上验证其功能,深入理解植物适应干旱、低温和高盐机制奠定基础.
CBF/DREB1(C-repeat binding factor/dehydration resistance element binding protein 1)是一類抗逆相關的轉錄因子,它們的錶達可以激活下遊一繫列抗逆應答基因的錶達,從而提高植株的抗逆性.沙鼕青(A mmopiptanthus mongolicus)主要生長在中國西北荒漠和半荒漠地帶,是典型的旱生資源植物,具有突齣的抗寒、抗旱、耐鹽堿特性.本文以沙鼕青為實驗材料,利用RT-PCR和RACE技術剋隆瞭沙鼕青CBF/DREB1基因cDNA序列,併對其進行瞭序列分析.結果錶明:沙鼕青CBF/DREB1轉錄因子基因序列全長為991 bp,包括624 bp的開放閱讀框(ORF),起始密碼子ATG,終止密碼子TAA,114 bp的5UTR和253 bp的3UTR,以及加尾信號AATAAA及poly(A)_(11).生物信息學預測其縯繹的氨基痠序列具有AP2結構域,且AP2結構域的兩耑擁有CBF傢族特有的PKK/PPAGRxKFxETRHP和DSAWR兩段短多肽序列,屬于CBF傢族.沙鼕青CBF/DREB1轉錄因子的剋隆為進一步研究植物抗逆和穫得抗性基因提供瞭新的候選基因,也為進一步從分子水平上驗證其功能,深入理解植物適應榦旱、低溫和高鹽機製奠定基礎.
CBF/DREB1(C-repeat binding factor/dehydration resistance element binding protein 1)시일류항역상관적전록인자,타문적표체가이격활하유일계렬항역응답기인적표체,종이제고식주적항역성.사동청(A mmopiptanthus mongolicus)주요생장재중국서북황막화반황막지대,시전형적한생자원식물,구유돌출적항한、항한、내염감특성.본문이사동청위실험재료,이용RT-PCR화RACE기술극륭료사동청CBF/DREB1기인cDNA서렬,병대기진행료서렬분석.결과표명:사동청CBF/DREB1전록인자기인서렬전장위991 bp,포괄624 bp적개방열독광(ORF),기시밀마자ATG,종지밀마자TAA,114 bp적5UTR화253 bp적3UTR,이급가미신호AATAAA급poly(A)_(11).생물신식학예측기연역적안기산서렬구유AP2결구역,차AP2결구역적량단옹유CBF가족특유적PKK/PPAGRxKFxETRHP화DSAWR량단단다태서렬,속우CBF가족.사동청CBF/DREB1전록인자적극륭위진일보연구식물항역화획득항성기인제공료신적후선기인,야위진일보종분자수평상험증기공능,심입리해식물괄응간한、저온화고염궤제전정기출.