基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2009年
6期
1049-1055
,共7页
郑红霞%窦同海%蔡燕燕%詹晓莹%沈逢焘%吴奇涵
鄭紅霞%竇同海%蔡燕燕%詹曉瑩%瀋逢燾%吳奇涵
정홍하%두동해%채연연%첨효형%침봉도%오기함
miRNA%转录调控%保守序列%生物信息学
miRNA%轉錄調控%保守序列%生物信息學
miRNA%전록조공%보수서렬%생물신식학
miRNA%Transcriptional regulation%Conserved sequence%Bioinformaties
MicroRNA(miPNA)的表达调控方式一直是一个有争议的问题,为了研究miRNA潜在的转录调控特点,本文通过Sanger网站miRNA数据库获得人类miRNA的信息,并建立miRNA相关信息数据库,用MEME和Wordspy两个软件对其上游2 000 bp序列进行保守性分析,得到保守性的DNA序YU(motif),用TESS软件分析保守性DNA序列,预测其转录因子结合情况.通过比较位于基因间、反义链和内含子中的三类不同miRNA转录调控区的保守性和自主转录能力的差异,结果发现位于基因间、反义链上的miRNA上游调控区的保守性比位于内含子的miRNA高,在miRNA的转录调控区存在RNA聚合酶Ⅱ类型的转录因子结合位点,miRNA还表现出自身独特的转录调控方式.通过分析,我们还得到了miRNA表达调控中一些重要的转录因子以及独特的调控序列.本研究结果为miRNA转录调控机制的进一步研究提供了理论依据.
MicroRNA(miPNA)的錶達調控方式一直是一箇有爭議的問題,為瞭研究miRNA潛在的轉錄調控特點,本文通過Sanger網站miRNA數據庫穫得人類miRNA的信息,併建立miRNA相關信息數據庫,用MEME和Wordspy兩箇軟件對其上遊2 000 bp序列進行保守性分析,得到保守性的DNA序YU(motif),用TESS軟件分析保守性DNA序列,預測其轉錄因子結閤情況.通過比較位于基因間、反義鏈和內含子中的三類不同miRNA轉錄調控區的保守性和自主轉錄能力的差異,結果髮現位于基因間、反義鏈上的miRNA上遊調控區的保守性比位于內含子的miRNA高,在miRNA的轉錄調控區存在RNA聚閤酶Ⅱ類型的轉錄因子結閤位點,miRNA還錶現齣自身獨特的轉錄調控方式.通過分析,我們還得到瞭miRNA錶達調控中一些重要的轉錄因子以及獨特的調控序列.本研究結果為miRNA轉錄調控機製的進一步研究提供瞭理論依據.
MicroRNA(miPNA)적표체조공방식일직시일개유쟁의적문제,위료연구miRNA잠재적전록조공특점,본문통과Sanger망참miRNA수거고획득인류miRNA적신식,병건립miRNA상관신식수거고,용MEME화Wordspy량개연건대기상유2 000 bp서렬진행보수성분석,득도보수성적DNA서YU(motif),용TESS연건분석보수성DNA서렬,예측기전록인자결합정황.통과비교위우기인간、반의련화내함자중적삼류불동miRNA전록조공구적보수성화자주전록능력적차이,결과발현위우기인간、반의련상적miRNA상유조공구적보수성비위우내함자적miRNA고,재miRNA적전록조공구존재RNA취합매Ⅱ류형적전록인자결합위점,miRNA환표현출자신독특적전록조공방식.통과분석,아문환득도료miRNA표체조공중일사중요적전록인자이급독특적조공서렬.본연구결과위miRNA전록조공궤제적진일보연구제공료이론의거.
