热带亚热带植物学报
熱帶亞熱帶植物學報
열대아열대식물학보
JOURNAL OF TROPICAL AND SUBTROPICAL BOTANY
2013年
2期
116-122
,共7页
rbcL%matK%马鞭草科%豆腐柴属%系统学
rbcL%matK%馬鞭草科%豆腐柴屬%繫統學
rbcL%matK%마편초과%두부시속%계통학
为探究适用于马鞭草科植物的DNA条形码及该类群的系统分类关系,对豆腐柴(Premna microphylla)的叶绿体基因ycf6-psbM、trnV-atpE、rbcL、trnL-F、psbM-trnD、atpB-rbcL、trnC-ycf6、trnH-psbA、rpl36-infA-rps8和核基因ITS序列进行了PCR扩增和测序,结果表明,仅rbcL、trnl-F、trnH-psbA序列的PCR扩增以及测序效果较好,而ITS不能得到明显的扩增条带,ycf6-psbM不能成功测序,其它序列存在有部分双峰或噪值高等问题.根据DNA条形码标准,rbcL序列是所有测试条码中相对最适合的.应用rbcL和matK序列对马鞭草科(Verbenaceae)豆腐柴属、牡荆属(Vitex L.)、马鞭草属(Verbena L.)和大青属(Clerodendrum L.)等4属与唇形科宝盖草属(Lamium L.)、水苏属(Stachys L.)、鼠尾草属(Salvia L.)和香科科属(Teucrium L.)等4属的分类和系统发育关系进行分析,以紫草科Lithospermum multiflorum L.为外类群,最大简约法对2个片段的单独和联合矩阵分别构建系统发育树.豆腐柴属和大青属应从马鞭草科划入唇形科,马鞭草属仍归于马鞭草科,而牡荆属的系统学位置还需更多的证据.
為探究適用于馬鞭草科植物的DNA條形碼及該類群的繫統分類關繫,對豆腐柴(Premna microphylla)的葉綠體基因ycf6-psbM、trnV-atpE、rbcL、trnL-F、psbM-trnD、atpB-rbcL、trnC-ycf6、trnH-psbA、rpl36-infA-rps8和覈基因ITS序列進行瞭PCR擴增和測序,結果錶明,僅rbcL、trnl-F、trnH-psbA序列的PCR擴增以及測序效果較好,而ITS不能得到明顯的擴增條帶,ycf6-psbM不能成功測序,其它序列存在有部分雙峰或譟值高等問題.根據DNA條形碼標準,rbcL序列是所有測試條碼中相對最適閤的.應用rbcL和matK序列對馬鞭草科(Verbenaceae)豆腐柴屬、牡荊屬(Vitex L.)、馬鞭草屬(Verbena L.)和大青屬(Clerodendrum L.)等4屬與脣形科寶蓋草屬(Lamium L.)、水囌屬(Stachys L.)、鼠尾草屬(Salvia L.)和香科科屬(Teucrium L.)等4屬的分類和繫統髮育關繫進行分析,以紫草科Lithospermum multiflorum L.為外類群,最大簡約法對2箇片段的單獨和聯閤矩陣分彆構建繫統髮育樹.豆腐柴屬和大青屬應從馬鞭草科劃入脣形科,馬鞭草屬仍歸于馬鞭草科,而牡荊屬的繫統學位置還需更多的證據.
위탐구괄용우마편초과식물적DNA조형마급해류군적계통분류관계,대두부시(Premna microphylla)적협록체기인ycf6-psbM、trnV-atpE、rbcL、trnL-F、psbM-trnD、atpB-rbcL、trnC-ycf6、trnH-psbA、rpl36-infA-rps8화핵기인ITS서렬진행료PCR확증화측서,결과표명,부rbcL、trnl-F、trnH-psbA서렬적PCR확증이급측서효과교호,이ITS불능득도명현적확증조대,ycf6-psbM불능성공측서,기타서렬존재유부분쌍봉혹조치고등문제.근거DNA조형마표준,rbcL서렬시소유측시조마중상대최괄합적.응용rbcL화matK서렬대마편초과(Verbenaceae)두부시속、모형속(Vitex L.)、마편초속(Verbena L.)화대청속(Clerodendrum L.)등4속여진형과보개초속(Lamium L.)、수소속(Stachys L.)、서미초속(Salvia L.)화향과과속(Teucrium L.)등4속적분류화계통발육관계진행분석,이자초과Lithospermum multiflorum L.위외류군,최대간약법대2개편단적단독화연합구진분별구건계통발육수.두부시속화대청속응종마편초과화입진형과,마편초속잉귀우마편초과,이모형속적계통학위치환수경다적증거.
