热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2014年
3期
542-550
,共9页
枇杷%试管苗%CAT%基因克隆%表达分析
枇杷%試管苗%CAT%基因剋隆%錶達分析
비파%시관묘%CAT%기인극륭%표체분석
Eriobotrya japonica%In vitro plantlets%Catalase gene%Gene cloning%Expression analysis
以早钟6号枇杷试管苗叶片为试验材料,采用同源克隆方法从叶片mRNA中分离得到CAT基因的2个成员j-CA T1和Ej-CA T2,Ej-CA T1 cDNA序列全长1 738 bp,包括1 479 bp ORF和257 bp 3'-UTR; Ej-CAT2序列全长1 742 bp,包含1 479 bp ORF及261 bp 3'-UTR.2个CAT基因成员的核苷酸序列相似性为98.04%,其开放阅读框推导的氨基酸序列具有97.32%的相似性.生物信息学分析结果表明:2个蛋白均编码492个氨基酸,是亲水蛋白,不含信号肽,不存在螺旋卷曲结构,是非跨膜蛋白,亚细胞定位于过氧化物酶体;Ej-CAT1及Ej-CAT2蛋白分别有18、17个功能位点,22、19个磷酸化位点.CAT基因在枇杷试管苗离体保存过程中不同时期具有不同的表达量,整体趋势呈“W”形状,在离体保存1个月时表达量最高,保存7个月时表达量最低.CAT表达量变化可能跟枇杷试管苗的生长发育模式有关.
以早鐘6號枇杷試管苗葉片為試驗材料,採用同源剋隆方法從葉片mRNA中分離得到CAT基因的2箇成員j-CA T1和Ej-CA T2,Ej-CA T1 cDNA序列全長1 738 bp,包括1 479 bp ORF和257 bp 3'-UTR; Ej-CAT2序列全長1 742 bp,包含1 479 bp ORF及261 bp 3'-UTR.2箇CAT基因成員的覈苷痠序列相似性為98.04%,其開放閱讀框推導的氨基痠序列具有97.32%的相似性.生物信息學分析結果錶明:2箇蛋白均編碼492箇氨基痠,是親水蛋白,不含信號肽,不存在螺鏇捲麯結構,是非跨膜蛋白,亞細胞定位于過氧化物酶體;Ej-CAT1及Ej-CAT2蛋白分彆有18、17箇功能位點,22、19箇燐痠化位點.CAT基因在枇杷試管苗離體保存過程中不同時期具有不同的錶達量,整體趨勢呈“W”形狀,在離體保存1箇月時錶達量最高,保存7箇月時錶達量最低.CAT錶達量變化可能跟枇杷試管苗的生長髮育模式有關.
이조종6호비파시관묘협편위시험재료,채용동원극륭방법종협편mRNA중분리득도CAT기인적2개성원j-CA T1화Ej-CA T2,Ej-CA T1 cDNA서렬전장1 738 bp,포괄1 479 bp ORF화257 bp 3'-UTR; Ej-CAT2서렬전장1 742 bp,포함1 479 bp ORF급261 bp 3'-UTR.2개CAT기인성원적핵감산서렬상사성위98.04%,기개방열독광추도적안기산서렬구유97.32%적상사성.생물신식학분석결과표명:2개단백균편마492개안기산,시친수단백,불함신호태,불존재라선권곡결구,시비과막단백,아세포정위우과양화물매체;Ej-CAT1급Ej-CAT2단백분별유18、17개공능위점,22、19개린산화위점.CAT기인재비파시관묘리체보존과정중불동시기구유불동적표체량,정체추세정“W”형상,재리체보존1개월시표체량최고,보존7개월시표체량최저.CAT표체량변화가능근비파시관묘적생장발육모식유관.