植物学报
植物學報
식물학보
BULLETIN OF BOTANY
2009年
5期
608-618
,共11页
王静%王艇%苏应娟%森林%张冰%杨永霞
王靜%王艇%囌應娟%森林%張冰%楊永霞
왕정%왕정%소응연%삼림%장빙%양영하
适应性进化%裸子植物%PHY-PAS1结构域%PHYP基因
適應性進化%裸子植物%PHY-PAS1結構域%PHYP基因
괄응성진화%라자식물%PHY-PAS1결구역%PHYP기인
光敏色素是一类红光/远红光受体,在植物种子萌发到成熟的整个生长发育过程中均起重要的调节作用.光敏色素PHY-PAS1结构域存在于光敏色素基因家族的所有成员中,对调节发色团的光谱特性和光信号转导非常关键.光敏色素基因家族通过基因重复产生,而基因重复可能与物种形成有关.PHYP基因是裸子植物光敏色素基因家族发生第1次重复后产生的,并且以单拷贝形式存在.为了研究不同裸子植物PHYP基因编码蛋白的PHY-PAS1结构域在进化过程中是否受到相同的选择压力以及是否发生了适应性进化.该研究利用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对裸子植物31条PHYP基因序列编码蛋白的PHY-PAS1结构域所受到的选择压力进行了分析.结果表明,在由PHY-PAS1结构域序列构建的系统树中,多数分支处于强烈的负选择压力下(ω<1);有14个分支处于正选择压力下(ω>1),其中13个分支发生在属内种间;与之相比,在较为古老的谱系中相对缺少这种正选择压力.
光敏色素是一類紅光/遠紅光受體,在植物種子萌髮到成熟的整箇生長髮育過程中均起重要的調節作用.光敏色素PHY-PAS1結構域存在于光敏色素基因傢族的所有成員中,對調節髮色糰的光譜特性和光信號轉導非常關鍵.光敏色素基因傢族通過基因重複產生,而基因重複可能與物種形成有關.PHYP基因是裸子植物光敏色素基因傢族髮生第1次重複後產生的,併且以單拷貝形式存在.為瞭研究不同裸子植物PHYP基因編碼蛋白的PHY-PAS1結構域在進化過程中是否受到相同的選擇壓力以及是否髮生瞭適應性進化.該研究利用分支模型、位點模型以及分支-位點模型對裸子植物31條PHYP基因序列編碼蛋白的PHY-PAS1結構域所受到的選擇壓力進行瞭分析.結果錶明,在由PHY-PAS1結構域序列構建的繫統樹中,多數分支處于彊烈的負選擇壓力下(ω<1);有14箇分支處于正選擇壓力下(ω>1),其中13箇分支髮生在屬內種間;與之相比,在較為古老的譜繫中相對缺少這種正選擇壓力.
광민색소시일류홍광/원홍광수체,재식물충자맹발도성숙적정개생장발육과정중균기중요적조절작용.광민색소PHY-PAS1결구역존재우광민색소기인가족적소유성원중,대조절발색단적광보특성화광신호전도비상관건.광민색소기인가족통과기인중복산생,이기인중복가능여물충형성유관.PHYP기인시라자식물광민색소기인가족발생제1차중복후산생적,병차이단고패형식존재.위료연구불동라자식물PHYP기인편마단백적PHY-PAS1결구역재진화과정중시부수도상동적선택압력이급시부발생료괄응성진화.해연구이용분지모형、위점모형이급분지-위점모형대라자식물31조PHYP기인서렬편마단백적PHY-PAS1결구역소수도적선택압력진행료분석.결과표명,재유PHY-PAS1결구역서렬구건적계통수중,다수분지처우강렬적부선택압력하(ω<1);유14개분지처우정선택압력하(ω>1),기중13개분지발생재속내충간;여지상비,재교위고로적보계중상대결소저충정선택압력.
