物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2009年
10期
2107-2112
,共6页
刘滔%孙茂堂%董晓武%任欣%杨欣%杜立林%胡永洲
劉滔%孫茂堂%董曉武%任訢%楊訢%杜立林%鬍永洲
류도%손무당%동효무%임흔%양흔%두립림%호영주
分子对接%CDK7抑制剂%LigandFit模块%LigScore2打分函数%合成%抗肿瘤活性
分子對接%CDK7抑製劑%LigandFit模塊%LigScore2打分函數%閤成%抗腫瘤活性
분자대접%CDK7억제제%LigandFit모괴%LigScore2타분함수%합성%항종류활성
根据细胞周期依赖性激酶7(CDK7)的蛋白结构,利用Discovery Studio 2.1程序包中的LigandFit模块建立了CDK7抑制剂的分子对接模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)方法选择LigScore2为最佳打分函数(ROC曲线下的面积为0.95),并验证了该模型的准确性.利用该模型对设计的化合物与CDK7蛋白进行对接分析,得到了2个打分最高的化合物16、17,进而通过13步的合成路线,以中等至高的收率得到目标化合物,并测定其体外抗肿瘤活性.结果表明,所合成的化合物对急性前髓细胞性白血病细胞(HL60)、鼻咽癌细胞(KB)、肝肿瘤细胞(SMMC-7721)、结肠腺癌细胞(HCT-116)、肺癌细胞(A549)细胞株均有抑制作用(IC50值为0.84-19.70 μmol·L-1),其中化合物16对HL60细胞株的IC50值最低,为0.84 μmol·L-1.
根據細胞週期依賴性激酶7(CDK7)的蛋白結構,利用Discovery Studio 2.1程序包中的LigandFit模塊建立瞭CDK7抑製劑的分子對接模型,採用受試者工作特徵麯線(ROC)方法選擇LigScore2為最佳打分函數(ROC麯線下的麵積為0.95),併驗證瞭該模型的準確性.利用該模型對設計的化閤物與CDK7蛋白進行對接分析,得到瞭2箇打分最高的化閤物16、17,進而通過13步的閤成路線,以中等至高的收率得到目標化閤物,併測定其體外抗腫瘤活性.結果錶明,所閤成的化閤物對急性前髓細胞性白血病細胞(HL60)、鼻嚥癌細胞(KB)、肝腫瘤細胞(SMMC-7721)、結腸腺癌細胞(HCT-116)、肺癌細胞(A549)細胞株均有抑製作用(IC50值為0.84-19.70 μmol·L-1),其中化閤物16對HL60細胞株的IC50值最低,為0.84 μmol·L-1.
근거세포주기의뢰성격매7(CDK7)적단백결구,이용Discovery Studio 2.1정서포중적LigandFit모괴건립료CDK7억제제적분자대접모형,채용수시자공작특정곡선(ROC)방법선택LigScore2위최가타분함수(ROC곡선하적면적위0.95),병험증료해모형적준학성.이용해모형대설계적화합물여CDK7단백진행대접분석,득도료2개타분최고적화합물16、17,진이통과13보적합성로선,이중등지고적수솔득도목표화합물,병측정기체외항종류활성.결과표명,소합성적화합물대급성전수세포성백혈병세포(HL60)、비인암세포(KB)、간종류세포(SMMC-7721)、결장선암세포(HCT-116)、폐암세포(A549)세포주균유억제작용(IC50치위0.84-19.70 μmol·L-1),기중화합물16대HL60세포주적IC50치최저,위0.84 μmol·L-1.
