CAJ | 학술논문

从GenBank数据库上公布的5 025条核桃(Juglans regia)EST序列中,用SSRHunter软件搜索到485条EST序列中含有540个SSR,SSR出现频率为10.75%,SSR-ESTs检出率为9.7%.利用检出的SSR-ESTs序列设计SSR引物43对,对6个核桃样品、1个黑核桃(J.nigra)样品和1个核桃楸(J.mandshurica)样品进行了PCR扩增,其中40对引物有扩增带,占设计引物的93%,35对引物有多态性,占可扩增引物的87.5%.在有多态性的35对引物中,27对引物在核桃种内有多态性;8对引物在核桃种内无多态性,而在核桃、核桃楸和黑核桃种间有多态性.应用UPGMA方法对检测样品进行聚类分析,结果与传统分类一致.
종GenBank수거고상공포적5 025조핵도(Juglans regia)EST서렬중,용SSRHunter연건수색도485조EST서렬중함유540개SSR,SSR출현빈솔위10.75%,SSR-ESTs검출솔위9.7%.이용검출적SSR-ESTs서렬설계SSR인물43대,대6개핵도양품、1개흑핵도(J.nigra)양품화1개핵도추(J.mandshurica)양품진행료PCR확증,기중40대인물유확증대,점설계인물적93%,35대인물유다태성,점가확증인물적87.5%.재유다태성적35대인물중,27대인물재핵도충내유다태성;8대인물재핵도충내무다태성,이재핵도、핵도추화흑핵도충간유다태성.응용UPGMA방법대검측양품진행취류분석,결과여전통분류일치.