甘蔗叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析
감자협편전장cDNA문고구건급EST서렬분석
Construction of Full-length cDNA Library from Sugarcane Leaves and the Corresponding EST Analysis
  • 万方数据
    农业生物技术学报 농업생물기술학보
    JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
    2009年 5期 843-850 ,共8页

    许莉萍%阙友雄%刘金仙%郭晋隆%郑益凤%徐景升%袁照年%陈平华%陈如凯

    허리평%궐우웅%류금선%곽진륭%정익봉%서경승%원조년%진평화%진여개

    甘蔗叶片%cDNA文库%表达序列标签(EST) 甘蔗葉片%cDNA文庫%錶達序列標籤(EST)
    감자협편%cDNA문고%표체서렬표첨(EST)
    以甘蔗(Saechamm Complex)3个生长时期的功能叶片为材料,利用Oligo-capping法构建了一个甘蔗叶片全长cDNA文库.经鉴定该文库库容为3.0×106cfu,重组率为89%,全长率为85%,平均插入片段约为1 kb.利用该文库获得了228条5'端有效表达序列标签(EST).生物信息学分析表明,EST序列拼接出154个假定独立转录本(tentative unique transeript, TUT);NCBI同源比对分析表明,其中117条EST拼接的87个TUTs与已知功能基因具有较高的同源性,这些EST涉及细胞生长、信号转导、蛋白质合成、转录、抗逆反应、能量代谢等功能.
    이감자(Saechamm Complex)3개생장시기적공능협편위재료,이용Oligo-capping법구건료일개감자협편전장cDNA문고.경감정해문고고용위3.0×106cfu,중조솔위89%,전장솔위85%,평균삽입편단약위1 kb.이용해문고획득료228조5'단유효표체서렬표첨(EST).생물신식학분석표명,EST서렬병접출154개가정독립전록본(tentative unique transeript, TUT);NCBI동원비대분석표명,기중117조EST병접적87개TUTs여이지공능기인구유교고적동원성,저사EST섭급세포생장、신호전도、단백질합성、전록、항역반응、능량대사등공능.
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