中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
31期
220-226
,共7页
毛乐心%赵昶灵%支伟特%陈文龙%陈中坚%缪康汝
毛樂心%趙昶靈%支偉特%陳文龍%陳中堅%繆康汝
모악심%조창령%지위특%진문룡%진중견%무강여
人参属%鲨烯合酶%生物信息学分析
人參屬%鯊烯閤酶%生物信息學分析
인삼속%사희합매%생물신식학분석
利用生物信息学方法对GenBank中人参属9种植物鲨烯合酶的cDNA序列以及其编码的氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性、亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域功能域和进化关系进行了初步预测和分析.结果表明:总体上人参属鲨烯合酶核苷酸序列相似性平均为96.245%,氨基酸相似性平均为95.5%.其二级结构预测结果显示9个鲨烯合酶氨基酸序列以α螺旋和无规则卷曲为主要组成部分.对9种人参属植物进行进化树分析发现可以分为2个亚族.对包括人参属9种植物在内的其他物种进行进化树分析可知,植物、动物、酵母分属不同的类群.通过分析人参属植物鲨烯合酶及其编码基因的生物信息学特征,可以为鲨烯合酶基因的克隆和遗传操作提供理论参考.
利用生物信息學方法對GenBank中人參屬9種植物鯊烯閤酶的cDNA序列以及其編碼的氨基痠序列的結構、理化性質、信號肽、疏水性、親水性、亞細胞定位、跨膜結構域功能域和進化關繫進行瞭初步預測和分析.結果錶明:總體上人參屬鯊烯閤酶覈苷痠序列相似性平均為96.245%,氨基痠相似性平均為95.5%.其二級結構預測結果顯示9箇鯊烯閤酶氨基痠序列以α螺鏇和無規則捲麯為主要組成部分.對9種人參屬植物進行進化樹分析髮現可以分為2箇亞族.對包括人參屬9種植物在內的其他物種進行進化樹分析可知,植物、動物、酵母分屬不同的類群.通過分析人參屬植物鯊烯閤酶及其編碼基因的生物信息學特徵,可以為鯊烯閤酶基因的剋隆和遺傳操作提供理論參攷.
이용생물신식학방법대GenBank중인삼속9충식물사희합매적cDNA서렬이급기편마적안기산서렬적결구、이화성질、신호태、소수성、친수성、아세포정위、과막결구역공능역화진화관계진행료초보예측화분석.결과표명:총체상인삼속사희합매핵감산서렬상사성평균위96.245%,안기산상사성평균위95.5%.기이급결구예측결과현시9개사희합매안기산서렬이α라선화무규칙권곡위주요조성부분.대9충인삼속식물진행진화수분석발현가이분위2개아족.대포괄인삼속9충식물재내적기타물충진행진화수분석가지,식물、동물、효모분속불동적류군.통과분석인삼속식물사희합매급기편마기인적생물신식학특정,가이위사희합매기인적극륭화유전조작제공이론삼고.