中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
31期
21-28
,共8页
付瑜华%夏志强%王海燕%王文泉
付瑜華%夏誌彊%王海燕%王文泉
부유화%하지강%왕해연%왕문천
叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶%高密度杂交膜%southern杂交%生物信息学
葉綠體ω-3脂肪痠去飽和酶%高密度雜交膜%southern雜交%生物信息學
협록체ω-3지방산거포화매%고밀도잡교막%southern잡교%생물신식학
旨在建立麻疯树BIBAC文库筛选目的基因快捷高效的方法,并对其克隆的叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶基因进行生物信息学分析.本研究利用高密度杂交膜从麻疯树BIBAC文库中筛选到含有叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶基因的克隆,对其测序并用生物信息软件对获得全长序列及编码的蛋白质序列的特性进行分析.将筛选到的阳性克隆进行测序,并将该序列与麻疯树叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶基因进行比对,相似性达到99%,证实此克隆为含叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶基因(JcFAD7)的BIBAC克隆.麻疯树叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶基因长度为2655 bp,含有8个外显子和7个内含子,编码525个氨基酸.该基因编码的蛋白质为不具有信号肽的亲水性蛋白,二级结构元件多为α-螺旋和无规则卷曲,含有2个大的跨膜区域,在麻疯树中为单拷贝.本研究建立了高密度杂交膜从BIBAC文库中筛选目的基因快速高效的方法,同时也验证了该方法的可行性并对克隆到的基因进行了生物信息学分析.
旨在建立痳瘋樹BIBAC文庫篩選目的基因快捷高效的方法,併對其剋隆的葉綠體ω-3脂肪痠去飽和酶基因進行生物信息學分析.本研究利用高密度雜交膜從痳瘋樹BIBAC文庫中篩選到含有葉綠體ω-3脂肪痠去飽和酶基因的剋隆,對其測序併用生物信息軟件對穫得全長序列及編碼的蛋白質序列的特性進行分析.將篩選到的暘性剋隆進行測序,併將該序列與痳瘋樹葉綠體ω-3脂肪痠去飽和酶基因進行比對,相似性達到99%,證實此剋隆為含葉綠體ω-3脂肪痠去飽和酶基因(JcFAD7)的BIBAC剋隆.痳瘋樹葉綠體ω-3脂肪痠去飽和酶基因長度為2655 bp,含有8箇外顯子和7箇內含子,編碼525箇氨基痠.該基因編碼的蛋白質為不具有信號肽的親水性蛋白,二級結構元件多為α-螺鏇和無規則捲麯,含有2箇大的跨膜區域,在痳瘋樹中為單拷貝.本研究建立瞭高密度雜交膜從BIBAC文庫中篩選目的基因快速高效的方法,同時也驗證瞭該方法的可行性併對剋隆到的基因進行瞭生物信息學分析.
지재건립마풍수BIBAC문고사선목적기인쾌첩고효적방법,병대기극륭적협록체ω-3지방산거포화매기인진행생물신식학분석.본연구이용고밀도잡교막종마풍수BIBAC문고중사선도함유협록체ω-3지방산거포화매기인적극륭,대기측서병용생물신식연건대획득전장서렬급편마적단백질서렬적특성진행분석.장사선도적양성극륭진행측서,병장해서렬여마풍수협록체ω-3지방산거포화매기인진행비대,상사성체도99%,증실차극륭위함협록체ω-3지방산거포화매기인(JcFAD7)적BIBAC극륭.마풍수협록체ω-3지방산거포화매기인장도위2655 bp,함유8개외현자화7개내함자,편마525개안기산.해기인편마적단백질위불구유신호태적친수성단백,이급결구원건다위α-라선화무규칙권곡,함유2개대적과막구역,재마풍수중위단고패.본연구건립료고밀도잡교막종BIBAC문고중사선목적기인쾌속고효적방법,동시야험증료해방법적가행성병대극륭도적기인진행료생물신식학분석.