家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2009年
5期
19-23
,共5页
姜宁朋%孙健全%黄庆华%王可
薑寧朋%孫健全%黃慶華%王可
강저붕%손건전%황경화%왕가
猪传染性胃肠炎病毒%二级结构%B细胞抗原表位
豬傳染性胃腸炎病毒%二級結構%B細胞抗原錶位
저전염성위장염병독%이급결구%B세포항원표위
以TGEV基因组序列为基础,运用Garnier-Robson、Chou-fasman和Karplus-Schulz方法预测猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构.运用Kyte-Doolitte方法对N蛋白的疏水性进行了分析,Jameson-Wolf方法预测了结构蛋白的抗原指数,Emini方法预测了N蛋白的表面可能性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测B细胞抗原表位.结果显示柔性区域主要集中在N-端第11~31、52~65、128~147、155~188、210~227、313~319、331~347区段,α-螺旋和β-折叠数量少且分散.N蛋白可能的B细胞抗原位点是N-端12~31, 154~191, 204~243,309~320,329~354区段,而这些区段内部或附近都有柔性区域存在,可作为N蛋白的抗原优势表位.本研究为TGEV抗原优势表位的试验研究和反向疫苗的研制奠定了基础.
以TGEV基因組序列為基礎,運用Garnier-Robson、Chou-fasman和Karplus-Schulz方法預測豬傳染性胃腸炎病毒N蛋白的二級結構.運用Kyte-Doolitte方法對N蛋白的疏水性進行瞭分析,Jameson-Wolf方法預測瞭結構蛋白的抗原指數,Emini方法預測瞭N蛋白的錶麵可能性,最後結閤吳玉章的方法綜閤分析預測B細胞抗原錶位.結果顯示柔性區域主要集中在N-耑第11~31、52~65、128~147、155~188、210~227、313~319、331~347區段,α-螺鏇和β-摺疊數量少且分散.N蛋白可能的B細胞抗原位點是N-耑12~31, 154~191, 204~243,309~320,329~354區段,而這些區段內部或附近都有柔性區域存在,可作為N蛋白的抗原優勢錶位.本研究為TGEV抗原優勢錶位的試驗研究和反嚮疫苗的研製奠定瞭基礎.
이TGEV기인조서렬위기출,운용Garnier-Robson、Chou-fasman화Karplus-Schulz방법예측저전염성위장염병독N단백적이급결구.운용Kyte-Doolitte방법대N단백적소수성진행료분석,Jameson-Wolf방법예측료결구단백적항원지수,Emini방법예측료N단백적표면가능성,최후결합오옥장적방법종합분석예측B세포항원표위.결과현시유성구역주요집중재N-단제11~31、52~65、128~147、155~188、210~227、313~319、331~347구단,α-라선화β-절첩수량소차분산.N단백가능적B세포항원위점시N-단12~31, 154~191, 204~243,309~320,329~354구단,이저사구단내부혹부근도유유성구역존재,가작위N단백적항원우세표위.본연구위TGEV항원우세표위적시험연구화반향역묘적연제전정료기출.
