海洋与湖沼
海洋與湖沼
해양여호소
OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA
2009年
5期
563-571
,共9页
刘楚吾%徐田军%刘丽%郭昱嵩%董秋芬
劉楚吾%徐田軍%劉麗%郭昱嵩%董鞦芬
류초오%서전군%류려%곽욱숭%동추분
笛鲷属%16S rRNA%序列比较%分子系统学
笛鯛屬%16S rRNA%序列比較%分子繫統學
적조속%16S rRNA%서렬비교%분자계통학
对笛鲷属9种鱼的线粒体DNA 16S rRNA基因片段进行了PCR扩增,扩增产物经纯化后测序,得到了长度为561bp的分析序列.结合GenBank中的另外9种笛鲷的16S rRNA同源序列计算得出A、T、G、C的含量平均为28.5%、22.1%、23.6%和25.8%,AT含量稍高于GC含量,18种笛鲷碱基组成差异不大.利用MEGA3.1软件对所得序列进行比对后检测到72个变异位点,其中包括简约信息位点44个,在变异位点中75.61%的碱基替换是由于发生了转换,转换/颠换平均为3.1:1.计算了种间的遗传距离,结果表明,序列差异在0.0193-0.0680之间,其中勒氏笛鲷和金焰笛鲷、勒氏笛鲷和金带笛鲷的序列差异最小,而红鳍笛鲷和金焰笛鲷、红鳍笛鲷和画眉笛鲷的序列差异最大.选用高体四长棘鲷(Argyrops spinifer)为外群,利用NJ法构建了分子系统树,结果表明:本研究中的9种南海笛鲷与其它9种笛鲷进化关系较远;并且南海9种笛鲷相互之间仍然保持着着相对较远的遗传距离,遗传多样性较好.
對笛鯛屬9種魚的線粒體DNA 16S rRNA基因片段進行瞭PCR擴增,擴增產物經純化後測序,得到瞭長度為561bp的分析序列.結閤GenBank中的另外9種笛鯛的16S rRNA同源序列計算得齣A、T、G、C的含量平均為28.5%、22.1%、23.6%和25.8%,AT含量稍高于GC含量,18種笛鯛堿基組成差異不大.利用MEGA3.1軟件對所得序列進行比對後檢測到72箇變異位點,其中包括簡約信息位點44箇,在變異位點中75.61%的堿基替換是由于髮生瞭轉換,轉換/顛換平均為3.1:1.計算瞭種間的遺傳距離,結果錶明,序列差異在0.0193-0.0680之間,其中勒氏笛鯛和金燄笛鯛、勒氏笛鯛和金帶笛鯛的序列差異最小,而紅鰭笛鯛和金燄笛鯛、紅鰭笛鯛和畫眉笛鯛的序列差異最大.選用高體四長棘鯛(Argyrops spinifer)為外群,利用NJ法構建瞭分子繫統樹,結果錶明:本研究中的9種南海笛鯛與其它9種笛鯛進化關繫較遠;併且南海9種笛鯛相互之間仍然保持著著相對較遠的遺傳距離,遺傳多樣性較好.
대적조속9충어적선립체DNA 16S rRNA기인편단진행료PCR확증,확증산물경순화후측서,득도료장도위561bp적분석서렬.결합GenBank중적령외9충적조적16S rRNA동원서렬계산득출A、T、G、C적함량평균위28.5%、22.1%、23.6%화25.8%,AT함량초고우GC함량,18충적조감기조성차이불대.이용MEGA3.1연건대소득서렬진행비대후검측도72개변이위점,기중포괄간약신식위점44개,재변이위점중75.61%적감기체환시유우발생료전환,전환/전환평균위3.1:1.계산료충간적유전거리,결과표명,서렬차이재0.0193-0.0680지간,기중륵씨적조화금염적조、륵씨적조화금대적조적서렬차이최소,이홍기적조화금염적조、홍기적조화화미적조적서렬차이최대.선용고체사장극조(Argyrops spinifer)위외군,이용NJ법구건료분자계통수,결과표명:본연구중적9충남해적조여기타9충적조진화관계교원;병차남해9충적조상호지간잉연보지착착상대교원적유전거리,유전다양성교호.