CAJ | 학술논문

钩端螺旋体(简称钩体)可以引起严重的人兽共患病,是威胁人类健康的传染病之一.课题组率先开展了对中国主要致病流行株56601的全基因组测序工作,测序结果显示钩体有两条染色体,共编码4 727个基因,后经重新注释为3 718个基因.基于56601株的参考序列,对其减毒株IPAV的测序结果表明,除了有101个基因出现突变之外,IPAV株基因组的大小及基因结构组成与56601株相同.基于基因组序列,课题组设计并合成了钩体的基因组芯片,开展了比较基因组学及转录组学的研究.比较基因组学研究结果显示,钩体的核心基因有2 917个,变异基因有275个,并首次发现钩体基因组中存在2个基因岛.模拟体内外钩体生长的温度条件进行转录组学分析,共发现106个基因差异表达,分属9类不同的功能；对有毒株56601及减毒株IPAV进行转录组学分析,发现了差异上调表达的22 kb的类噬菌体片段.对体外培养的56601株进行蛋白组学分析,鉴定出2 540个蛋白,进一步对这些蛋白进行磷酸化、乙酰化及甲基化的修饰进行分析,发现了32个磷酸化位点、46个乙酰化位点和155个甲基化位点.通过分析发现,钩体蛋白的很多修饰方式类似于真核生物,提示钩体在进化上比较特殊.比较毒力株56601与减毒株IPAV的蛋白组异同,一致表达的蛋白1 627个,差异表达的蛋白402个.基于以上基因组学及蛋白组学研究,课题组进一步开展了对钩体相关功能基因的研究,这些研究均为揭示钩体的致病机制、开发钩体的疫苗及诊断试剂、最终防控钩体病奠定了基础.
구단라선체(간칭구체)가이인기엄중적인수공환병,시위협인류건강적전염병지일.과제조솔선개전료대중국주요치병류행주56601적전기인조측서공작,측서결과현시구체유량조염색체,공편마4 727개기인,후경중신주석위3 718개기인.기우56601주적삼고서렬,대기감독주IPAV적측서결과표명,제료유101개기인출현돌변지외,IPAV주기인조적대소급기인결구조성여56601주상동.기우기인조서렬,과제조설계병합성료구체적기인조심편,개전료비교기인조학급전록조학적연구.비교기인조학연구결과현시,구체적핵심기인유2 917개,변이기인유275개,병수차발현구체기인조중존재2개기인도.모의체내외구체생장적온도조건진행전록조학분석,공발현106개기인차이표체,분속9류불동적공능；대유독주56601급감독주IPAV진행전록조학분석,발현료차이상조표체적22 kb적류서균체편단.대체외배양적56601주진행단백조학분석,감정출2 540개단백,진일보대저사단백진행린산화、을선화급갑기화적수식진행분석,발현료32개린산화위점、46개을선화위점화155개갑기화위점.통과분석발현,구체단백적흔다수식방식유사우진핵생물,제시구체재진화상비교특수.비교독력주56601여감독주IPAV적단백조이동,일치표체적단백1 627개,차이표체적단백402개.기우이상기인조학급단백조학연구,과제조진일보개전료대구체상관공능기인적연구,저사연구균위게시구체적치병궤제、개발구체적역묘급진단시제、최종방공구체병전정료기출.