中国水稻科学
中國水稻科學
중국수도과학
CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE
2008年
4期
427-431
,共5页
敖雁%胡治球%汤在祥%王学枫%徐辰武
敖雁%鬍治毬%湯在祥%王學楓%徐辰武
오안%호치구%탕재상%왕학풍%서신무
相关群体%数量性状座位%基因定位%极大似然估计方法
相關群體%數量性狀座位%基因定位%極大似然估計方法
상관군체%수량성상좌위%기인정위%겁대사연고계방법
对多亲本杂交衍生的多个群体的联合分析将有助于QTL的定位和基于QTL分析的育种实践,但目前还没有一个可对这类群体进行联合分析的通用方法.在以往发展的双亲杂交衍生的多个相关群体QTL图谱的联合构建方法的基础上,进一步拓展为可以对多个亲本杂交衍生的多个相关群体进行联合分析.首先建立了多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL联合作图的通用遗传模型,然后根据混合分布理论建立基于EM(expectation maximization)算法实现的QTL作图的极大似然估计方法.以循环杂交设计的3个F2群体为例用计算机模拟数据研究了QTL遗传力和样本容量2个因素对方法的影响.结果表明,无论是统计功效,还是参数估计的准确度和精确度,相同遗传力下,对循环杂交设计的3个F2群体联合作图均优于对其中的任2个F2群体联合作图.该方法的主要优点:一是可以比较和综合已有的对单个作图群体的定位结果,提高QTL检测的功效和定位的精度;二是在多亲本涉及的等位基因数更多的情形下,可以扩大和发掘有关数量性状的基因资源,从而为育种学家改良相应的数量性状奠定重要基础.
對多親本雜交衍生的多箇群體的聯閤分析將有助于QTL的定位和基于QTL分析的育種實踐,但目前還沒有一箇可對這類群體進行聯閤分析的通用方法.在以往髮展的雙親雜交衍生的多箇相關群體QTL圖譜的聯閤構建方法的基礎上,進一步拓展為可以對多箇親本雜交衍生的多箇相關群體進行聯閤分析.首先建立瞭多親本雜交衍生的多箇相關群體QTL聯閤作圖的通用遺傳模型,然後根據混閤分佈理論建立基于EM(expectation maximization)算法實現的QTL作圖的極大似然估計方法.以循環雜交設計的3箇F2群體為例用計算機模擬數據研究瞭QTL遺傳力和樣本容量2箇因素對方法的影響.結果錶明,無論是統計功效,還是參數估計的準確度和精確度,相同遺傳力下,對循環雜交設計的3箇F2群體聯閤作圖均優于對其中的任2箇F2群體聯閤作圖.該方法的主要優點:一是可以比較和綜閤已有的對單箇作圖群體的定位結果,提高QTL檢測的功效和定位的精度;二是在多親本涉及的等位基因數更多的情形下,可以擴大和髮掘有關數量性狀的基因資源,從而為育種學傢改良相應的數量性狀奠定重要基礎.
대다친본잡교연생적다개군체적연합분석장유조우QTL적정위화기우QTL분석적육충실천,단목전환몰유일개가대저류군체진행연합분석적통용방법.재이왕발전적쌍친잡교연생적다개상관군체QTL도보적연합구건방법적기출상,진일보탁전위가이대다개친본잡교연생적다개상관군체진행연합분석.수선건립료다친본잡교연생적다개상관군체QTL연합작도적통용유전모형,연후근거혼합분포이론건립기우EM(expectation maximization)산법실현적QTL작도적겁대사연고계방법.이순배잡교설계적3개F2군체위례용계산궤모의수거연구료QTL유전력화양본용량2개인소대방법적영향.결과표명,무론시통계공효,환시삼수고계적준학도화정학도,상동유전력하,대순배잡교설계적3개F2군체연합작도균우우대기중적임2개F2군체연합작도.해방법적주요우점:일시가이비교화종합이유적대단개작도군체적정위결과,제고QTL검측적공효화정위적정도;이시재다친본섭급적등위기인수경다적정형하,가이확대화발굴유관수량성상적기인자원,종이위육충학가개량상응적수량성상전정중요기출.
