实用预防医学
實用預防醫學
실용예방의학
PRACTICAL PREVENTIVE MEDICINE
2012年
11期
1604-1608
,共5页
郑娟娟%孙远洁%李昂%温琪%佟海龙%刘艳%赵晓雯
鄭娟娟%孫遠潔%李昂%溫琪%佟海龍%劉豔%趙曉雯
정연연%손원길%리앙%온기%동해룡%류염%조효문
单核苷酸多态性%相对危险度%遗传模型%x2检验%错误发现率
單覈苷痠多態性%相對危險度%遺傳模型%x2檢驗%錯誤髮現率
단핵감산다태성%상대위험도%유전모형%x2검험%착오발현솔
目的 在单核苷酸多态性(SNPs)数据中探讨不同模拟条件x2检验结合错误发现率(FDR)筛选SNPs位点的适用条件.方法 依据2009年2月发布HapMapⅢ期美国犹他州北欧和西欧后裔人群22号染色体前5000个SNPs数据,采用HAPGEN2模拟病例对照数据,运用Haploview4.2筛选标签SNPs(TagSNPs),比较不同模拟条件筛选致病SNPs的正确率.结果 相对危险度(RR)获取方式无显著差异；3种遗传模型均表现正确率随RR值增大而增高,RR相同时,加性模型正确率最高,显性模型次之,隐性模型最低；加性模型RR＞2.2、显性模型RR＞4和隐性模型RR＞5时,正确率超过60％.结论 x2检验结合FDR在加性模型效果最佳,实际科研工作需依据目标疾病具体情况考虑是否适合x2检验结合FDR方法.
目的 在單覈苷痠多態性(SNPs)數據中探討不同模擬條件x2檢驗結閤錯誤髮現率(FDR)篩選SNPs位點的適用條件.方法 依據2009年2月髮佈HapMapⅢ期美國猶他州北歐和西歐後裔人群22號染色體前5000箇SNPs數據,採用HAPGEN2模擬病例對照數據,運用Haploview4.2篩選標籤SNPs(TagSNPs),比較不同模擬條件篩選緻病SNPs的正確率.結果 相對危險度(RR)穫取方式無顯著差異；3種遺傳模型均錶現正確率隨RR值增大而增高,RR相同時,加性模型正確率最高,顯性模型次之,隱性模型最低；加性模型RR＞2.2、顯性模型RR＞4和隱性模型RR＞5時,正確率超過60％.結論 x2檢驗結閤FDR在加性模型效果最佳,實際科研工作需依據目標疾病具體情況攷慮是否適閤x2檢驗結閤FDR方法.
목적 재단핵감산다태성(SNPs)수거중탐토불동모의조건x2검험결합착오발현솔(FDR)사선SNPs위점적괄용조건.방법 의거2009년2월발포HapMapⅢ기미국유타주북구화서구후예인군22호염색체전5000개SNPs수거,채용HAPGEN2모의병례대조수거,운용Haploview4.2사선표첨SNPs(TagSNPs),비교불동모의조건사선치병SNPs적정학솔.결과 상대위험도(RR)획취방식무현저차이；3충유전모형균표현정학솔수RR치증대이증고,RR상동시,가성모형정학솔최고,현성모형차지,은성모형최저；가성모형RR＞2.2、현성모형RR＞4화은성모형RR＞5시,정학솔초과60％.결론 x2검험결합FDR재가성모형효과최가,실제과연공작수의거목표질병구체정황고필시부괄합x2검험결합FDR방법.
