广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
19期
120-123
,共4页
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嚮瀏訢%付于銀%王鞦娟%冉燕子%李露%蔡應繁
향류흔%부우은%왕추연%염연자%리로%채응번
茎瘤芥%酸性核糖体蛋白P1基因%克隆%序列分析
莖瘤芥%痠性覈糖體蛋白P1基因%剋隆%序列分析
경류개%산성핵당체단백P1기인%극륭%서렬분석
以茎瘤芥幼苗叶片总RNA为模板,通过SMART RACE技术进行反转录和PCR扩增,克隆到瘤芥酸性核糖体蛋白P1 基因(命名为BjARPP1,GenBank登录号:JX282179),并利用ProtParam、DNAMAN等生物信息学工具对其核酸序列和蛋白序列进行分析.结果表明,茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因开放阅读框为342 bp,编码113个氨基酸,等电点为4.27,相对分子质量为11.25 ku:二级结构预测显示α-螺旋占53.98％、不规则卷曲占33.68％、延伸链占12.39％,还含有5个磷酸化位点；同源进化树预测分析其与拟南芥的同源性为96％,与其他物种同源性低.茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因为首次克隆,为进一步研究该基因的结构、功能、遗传变异规律以及其与生产性能的关系提供科学依据.
以莖瘤芥幼苗葉片總RNA為模闆,通過SMART RACE技術進行反轉錄和PCR擴增,剋隆到瘤芥痠性覈糖體蛋白P1 基因(命名為BjARPP1,GenBank登錄號:JX282179),併利用ProtParam、DNAMAN等生物信息學工具對其覈痠序列和蛋白序列進行分析.結果錶明,莖瘤芥痠性覈糖體蛋白P1基因開放閱讀框為342 bp,編碼113箇氨基痠,等電點為4.27,相對分子質量為11.25 ku:二級結構預測顯示α-螺鏇佔53.98％、不規則捲麯佔33.68％、延伸鏈佔12.39％,還含有5箇燐痠化位點；同源進化樹預測分析其與擬南芥的同源性為96％,與其他物種同源性低.莖瘤芥痠性覈糖體蛋白P1基因為首次剋隆,為進一步研究該基因的結構、功能、遺傳變異規律以及其與生產性能的關繫提供科學依據.
이경류개유묘협편총RNA위모판,통과SMART RACE기술진행반전록화PCR확증,극륭도류개산성핵당체단백P1 기인(명명위BjARPP1,GenBank등록호:JX282179),병이용ProtParam、DNAMAN등생물신식학공구대기핵산서렬화단백서렬진행분석.결과표명,경류개산성핵당체단백P1기인개방열독광위342 bp,편마113개안기산,등전점위4.27,상대분자질량위11.25 ku:이급결구예측현시α-라선점53.98％、불규칙권곡점33.68％、연신련점12.39％,환함유5개린산화위점；동원진화수예측분석기여의남개적동원성위96％,여기타물충동원성저.경류개산성핵당체단백P1기인위수차극륭,위진일보연구해기인적결구、공능、유전변이규률이급기여생산성능적관계제공과학의거.
