热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2013年
12期
2508-2512
,共5页
肖冬来%陈丽华%陈宇航%杨菁%黄小菁
肖鼕來%陳麗華%陳宇航%楊菁%黃小菁
초동래%진려화%진우항%양정%황소정
正红菇%菌根围%真菌多样性%PCR变性梯度凝胶电泳
正紅菇%菌根圍%真菌多樣性%PCR變性梯度凝膠電泳
정홍고%균근위%진균다양성%PCR변성제도응효전영
Russula griseocarnosa%Mycorrhizosphere%Fungal diversity%PCR-DGGE
以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性.同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,Group Ⅰ主要为担子菌门(Basidiomycota)真菌,GroupⅡ主要为子囊菌门(Ascomycota)真菌,GroupⅢ为未知真菌,GroupⅣ主要为节肢动物门生物(Arthropoda).
以正紅菇(Russula griseocarnosa)菌根圍土壤為研究對象,通過提取土壤基因組DNA,以通用引物擴增真菌18S rRNA基因V1+V2區,將PCR產物進行變性梯度凝膠電泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),穫得土壤微生物群落的DNA特徵指紋圖譜,併對圖譜中的優勢條帶迴收測序,通過Blast進行同源性比對併構建繫統髮育樹,進而分析正紅菇菌根圍真菌群落組成及多樣性.同源性比對結果錶明,在迴收測序的19條DGGE條帶中,4條為非真菌真覈生物序列,繫統髮育分析顯示全部序列可以分為4類菌群,Group Ⅰ主要為擔子菌門(Basidiomycota)真菌,GroupⅡ主要為子囊菌門(Ascomycota)真菌,GroupⅢ為未知真菌,GroupⅣ主要為節肢動物門生物(Arthropoda).
이정홍고(Russula griseocarnosa)균근위토양위연구대상,통과제취토양기인조DNA,이통용인물확증진균18S rRNA기인V1+V2구,장PCR산물진행변성제도응효전영(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),획득토양미생물군락적DNA특정지문도보,병대도보중적우세조대회수측서,통과Blast진행동원성비대병구건계통발육수,진이분석정홍고균근위진균군락조성급다양성.동원성비대결과표명,재회수측서적19조DGGE조대중,4조위비진균진핵생물서렬,계통발육분석현시전부서렬가이분위4류균군,Group Ⅰ주요위담자균문(Basidiomycota)진균,GroupⅡ주요위자낭균문(Ascomycota)진균,GroupⅢ위미지진균,GroupⅣ주요위절지동물문생물(Arthropoda).
