高等学校化学学报
高等學校化學學報
고등학교화학학보
CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES
2013年
12期
2798-2805
,共8页
陈文雅%王珊珊%李冬玲%彭炜%赵静馥%段红霞
陳文雅%王珊珊%李鼕玲%彭煒%趙靜馥%段紅霞
진문아%왕산산%리동령%팽위%조정복%단홍하
气味结合蛋白%酰基哌啶类化合物%昆虫驱避剂%分子对接%三维定量构效关系
氣味結閤蛋白%酰基哌啶類化閤物%昆蟲驅避劑%分子對接%三維定量構效關繫
기미결합단백%선기고정류화합물%곤충구피제%분자대접%삼유정량구효관계
Odorant binding protein%Acylpiperidine compound%Insect repellent%Molecular docking%3D quantitative structure-activity relationship
利用Sybyl7.3软件对29个具有驱避活性的新型酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白AgamOBP1的结合模式进行研究,发现二者之间的结合以疏水作用和水桥作用为主.其中酰基哌啶类化合物末端的疏水片段可与AgamOBP1结合腔内狭长的疏水通道产生相互作用.同时,其关键药效基团——酰基氧可通过HOH153与AgamOBP1中的关键残基Trp114和Gly92或Cys95形成多重氢键作用.利用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)构建了新型酰基哌啶类化合物的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,其交叉验证系数T2ev分别为0.650和0.587.研究表明,在CoMSIA模型中,疏水场、静电场和立体场组合所得的三维构效关系模型最佳,其中尤以疏水场对这类酰基哌啶类化合物的驱避活性最为重要.基于AgamOBP1靶标结合口袋特征和酰基哌啶类化合物的3D-QSAR模型得出具有驱避活性的酰基哌啶类化合物的构效关系如下:在酰基C上引入一定碳链长度的疏水基团可使化合物表现出驱避活性,其中又以含9～10个C的化合物的驱避活性最佳,这与AgamOBP1结合口袋的疏水性质密不可分;当酰基端碳链长度一定时,在哌啶环上不宜引入立体效应过大的取代基,这是由AgamOBP1结合口袋的大小决定的;与哌啶N相连的酰基作为氢键受体基团,对于化合物识别与结合AgamOBP1蛋白至关重要.
利用Sybyl7.3軟件對29箇具有驅避活性的新型酰基哌啶類化閤物與氣味結閤蛋白AgamOBP1的結閤模式進行研究,髮現二者之間的結閤以疏水作用和水橋作用為主.其中酰基哌啶類化閤物末耑的疏水片段可與AgamOBP1結閤腔內狹長的疏水通道產生相互作用.同時,其關鍵藥效基糰——酰基氧可通過HOH153與AgamOBP1中的關鍵殘基Trp114和Gly92或Cys95形成多重氫鍵作用.利用比較分子力場分析法(CoMFA)和比較分子相似性指數分析法(CoMSIA)構建瞭新型酰基哌啶類化閤物的三維定量構效關繫(3D-QSAR)模型,其交扠驗證繫數T2ev分彆為0.650和0.587.研究錶明,在CoMSIA模型中,疏水場、靜電場和立體場組閤所得的三維構效關繫模型最佳,其中尤以疏水場對這類酰基哌啶類化閤物的驅避活性最為重要.基于AgamOBP1靶標結閤口袋特徵和酰基哌啶類化閤物的3D-QSAR模型得齣具有驅避活性的酰基哌啶類化閤物的構效關繫如下:在酰基C上引入一定碳鏈長度的疏水基糰可使化閤物錶現齣驅避活性,其中又以含9～10箇C的化閤物的驅避活性最佳,這與AgamOBP1結閤口袋的疏水性質密不可分;噹酰基耑碳鏈長度一定時,在哌啶環上不宜引入立體效應過大的取代基,這是由AgamOBP1結閤口袋的大小決定的;與哌啶N相連的酰基作為氫鍵受體基糰,對于化閤物識彆與結閤AgamOBP1蛋白至關重要.
이용Sybyl7.3연건대29개구유구피활성적신형선기고정류화합물여기미결합단백AgamOBP1적결합모식진행연구,발현이자지간적결합이소수작용화수교작용위주.기중선기고정류화합물말단적소수편단가여AgamOBP1결합강내협장적소수통도산생상호작용.동시,기관건약효기단——선기양가통과HOH153여AgamOBP1중적관건잔기Trp114화Gly92혹Cys95형성다중경건작용.이용비교분자력장분석법(CoMFA)화비교분자상사성지수분석법(CoMSIA)구건료신형선기고정류화합물적삼유정량구효관계(3D-QSAR)모형,기교차험증계수T2ev분별위0.650화0.587.연구표명,재CoMSIA모형중,소수장、정전장화입체장조합소득적삼유구효관계모형최가,기중우이소수장대저류선기고정류화합물적구피활성최위중요.기우AgamOBP1파표결합구대특정화선기고정류화합물적3D-QSAR모형득출구유구피활성적선기고정류화합물적구효관계여하:재선기C상인입일정탄련장도적소수기단가사화합물표현출구피활성,기중우이함9～10개C적화합물적구피활성최가,저여AgamOBP1결합구대적소수성질밀불가분;당선기단탄련장도일정시,재고정배상불의인입입체효응과대적취대기,저시유AgamOBP1결합구대적대소결정적;여고정N상련적선기작위경건수체기단,대우화합물식별여결합AgamOBP1단백지관중요.
