中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2013年
12期
55-61
,共7页
刘贵芹%邵群%黄荣峰%冯献忠
劉貴芹%邵群%黃榮峰%馮獻忠
류귀근%소군%황영봉%풍헌충
脂肪酸合成%DGAT基因家族%基因结构%基因表达
脂肪痠閤成%DGAT基因傢族%基因結構%基因錶達
지방산합성%DGAT기인가족%기인결구%기인표체
fatty acid synthesis%DGAT gene family%gene structure%gene expression
旨在利用生物信息学方法鉴定大豆DGAT基因,为其功能研究奠定基础。通过生物信息学的方法,在全基因组水平上对大豆DGAT基因家族进行了鉴定和分类,并分析了其基因结构、蛋白质结构域特征、系统发生及基因表达方式。结果表明:大豆中存在10个DGAT家族基因,分别属于DGAT1、DGAT2、DGAT3亚家族,分布在6条染色体上,其中DGAT1亚家族基因主要在茎端分生组织和绿色果荚中表达;DGAT3亚家族基因主要在根中表达;而DGAT2亚家族基因表达范围最广,主要在根瘤、叶、花和绿色果荚中表达。大豆DGAT家族基因在结构及表达上的差异揭示了其功能的多样性及大豆脂肪酸代谢的复杂性,将为研究大豆的脂肪酸代谢途径提供重要的信息。
旨在利用生物信息學方法鑒定大豆DGAT基因,為其功能研究奠定基礎。通過生物信息學的方法,在全基因組水平上對大豆DGAT基因傢族進行瞭鑒定和分類,併分析瞭其基因結構、蛋白質結構域特徵、繫統髮生及基因錶達方式。結果錶明:大豆中存在10箇DGAT傢族基因,分彆屬于DGAT1、DGAT2、DGAT3亞傢族,分佈在6條染色體上,其中DGAT1亞傢族基因主要在莖耑分生組織和綠色果莢中錶達;DGAT3亞傢族基因主要在根中錶達;而DGAT2亞傢族基因錶達範圍最廣,主要在根瘤、葉、花和綠色果莢中錶達。大豆DGAT傢族基因在結構及錶達上的差異揭示瞭其功能的多樣性及大豆脂肪痠代謝的複雜性,將為研究大豆的脂肪痠代謝途徑提供重要的信息。
지재이용생물신식학방법감정대두DGAT기인,위기공능연구전정기출。통과생물신식학적방법,재전기인조수평상대대두DGAT기인가족진행료감정화분류,병분석료기기인결구、단백질결구역특정、계통발생급기인표체방식。결과표명:대두중존재10개DGAT가족기인,분별속우DGAT1、DGAT2、DGAT3아가족,분포재6조염색체상,기중DGAT1아가족기인주요재경단분생조직화록색과협중표체;DGAT3아가족기인주요재근중표체;이DGAT2아가족기인표체범위최엄,주요재근류、협、화화록색과협중표체。대두DGAT가족기인재결구급표체상적차이게시료기공능적다양성급대두지방산대사적복잡성,장위연구대두적지방산대사도경제공중요적신식。
The aim was to identify the DGAT gene in soybean with bioinformatics methods, and provide the basis for studying its function. In this study, DGAT family genes of soybean were characterized in genome wide. Their gene structures and secondary structures of proteins, as well as phylogeny and expression pattern were also investigated. Phylogenetic analysis characterized 3 classes of DGAT genes in soybean, which are belonged to DGAT1, DGAT2 and DGAT3, and they distribute in 6 chromosomes of soybean genome. Whole genome expression analysis revealed that DGAT1 subfamily genes mainly expressed in SAM and green pod while DGAT3 subfamily genes mainly in root, DGAT2 family genes broadly expressed in nodule, leaf, flower and green pod. The difference of DGAT gene structures and expression patterns suggested that the function diversity and complexity of fatty acid metabolism. These results will provide important information for the fatty acid metabolism pathway in soybean.