军医进修学院学报
軍醫進脩學院學報
군의진수학원학보
ACADEMIC JOURNAL OF PLA POSTGRADUATE MEDICAL SCHOOL
2011年
7期
752-754
,共3页
迟小华%井绪臣%刘丽宏%杨波%卢学春%脱帅%脱朝伟
遲小華%井緒臣%劉麗宏%楊波%盧學春%脫帥%脫朝偉
지소화%정서신%류려굉%양파%로학춘%탈수%탈조위
氨磷汀%基因%生物信息学
氨燐汀%基因%生物信息學
안린정%기인%생물신식학
目的 利用开放性基因芯片数据库筛选氨磷汀调控人类造血及免疫相关基因并对其进行生物信息学分析.方法 以氨磷汀(Amifostine)为关键词,在互联网开放性数据库包括GEO、SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt和BLOCKS中搜索基因表达数据,对筛选出的数据库进行生物信息学分析,计算差异表达基因,再利用The Database for Annotation,Visualization andIntegrated Discovery(DAVID)数据库进行造血及免疫相关基因的功能聚类分析.结果 仅在GEO数据库中筛选出1个氨磷汀调控人类基因组表达数据库.分析表明,氨磷汀处理K562细胞后,人类全基因组仅2.14%(460/192 000)的基因在转录水平表达有显著差异(P＜0.01).460个差异基因中有139条为已知功能基因,聚类分析共筛出17个与造血及免疫相关的基因,分属于8大类生物学通路,其中上调基因15个,下调基因2个.结论 充分利用开放性基因芯片数据库,可经济、方便和快捷地分析药物调控人类基因表达谱特点,为预测和验证药物新的药理作用提供指导.
目的 利用開放性基因芯片數據庫篩選氨燐汀調控人類造血及免疫相關基因併對其進行生物信息學分析.方法 以氨燐汀(Amifostine)為關鍵詞,在互聯網開放性數據庫包括GEO、SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt和BLOCKS中搜索基因錶達數據,對篩選齣的數據庫進行生物信息學分析,計算差異錶達基因,再利用The Database for Annotation,Visualization andIntegrated Discovery(DAVID)數據庫進行造血及免疫相關基因的功能聚類分析.結果 僅在GEO數據庫中篩選齣1箇氨燐汀調控人類基因組錶達數據庫.分析錶明,氨燐汀處理K562細胞後,人類全基因組僅2.14%(460/192 000)的基因在轉錄水平錶達有顯著差異(P＜0.01).460箇差異基因中有139條為已知功能基因,聚類分析共篩齣17箇與造血及免疫相關的基因,分屬于8大類生物學通路,其中上調基因15箇,下調基因2箇.結論 充分利用開放性基因芯片數據庫,可經濟、方便和快捷地分析藥物調控人類基因錶達譜特點,為預測和驗證藥物新的藥理作用提供指導.
목적 이용개방성기인심편수거고사선안린정조공인류조혈급면역상관기인병대기진행생물신식학분석.방법 이안린정(Amifostine)위관건사,재호련망개방성수거고포괄GEO、SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt화BLOCKS중수색기인표체수거,대사선출적수거고진행생물신식학분석,계산차이표체기인,재이용The Database for Annotation,Visualization andIntegrated Discovery(DAVID)수거고진행조혈급면역상관기인적공능취류분석.결과 부재GEO수거고중사선출1개안린정조공인류기인조표체수거고.분석표명,안린정처리K562세포후,인류전기인조부2.14%(460/192 000)적기인재전록수평표체유현저차이(P＜0.01).460개차이기인중유139조위이지공능기인,취류분석공사출17개여조혈급면역상관적기인,분속우8대류생물학통로,기중상조기인15개,하조기인2개.결론 충분이용개방성기인심편수거고,가경제、방편화쾌첩지분석약물조공인류기인표체보특점,위예측화험증약물신적약리작용제공지도.
