应用ClinProt 系统分析食管癌家族史相关血清蛋白表达谱
응용ClinProt 계통분석식관암가족사상관혈청단백표체보
Analysis of protein expression spectrum related to esophageal cancer family history by ClinProt system
  • 万方数据
    河南大学学报（医学版） 하남대학학보（의학판）
    JOURNAL OF HENAN UNIVERSITY (MEDICAL SCIENCE)
    2012年 3期 191-196 ,共6页

    李秀敏%赵志敏%许洁%常廷民%崔娟%申芳芳%周福有%王建坡%常扶保%王立东

    리수민%조지민%허길%상정민%최연%신방방%주복유%왕건파%상부보%왕립동

    液体蛋白芯片飞行时间质谱系统%食管癌%家族史%遗传易感性 液體蛋白芯片飛行時間質譜繫統%食管癌%傢族史%遺傳易感性
    액체단백심편비행시간질보계통%식관암%가족사%유전역감성
    目的 寻找可能与食管癌患者食管癌家族史相关的血清标志物.方法 收集林州及其周边食管癌高发区食管癌家族史阳性食管癌患者28 例和食管癌家族史阴性食管癌患者38 例血清样本,经Clinprot 磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS )分析建立相应的蛋白质指纹图谱,应用ClinProTools 生物信息学方法 研究其血清蛋白表达谱.比较食管癌家族史阳性和阴性的食管癌患者血清蛋白表达谱,筛选出可能与食管癌家族史相关的差异蛋白.每组样品采用sigma 血清进行批间重复性检测.结果 平均CV 值为0.232 ;在相对分子质量800 ～ 10 000 范围内,共检测到家族史阳性与阴性食管癌患者血清差异蛋白101 个.选取组合分组能力最好的5 个质荷比(M /Z)分别为5 248.24 、5 905.05 、2 023.12 、2 953.07 、4 467.16 的蛋白峰建立模型并验证,显示食管癌家族史阳性组和阴性组的血清差异蛋白表达无显著性差异(P＞ 0.05).对食管癌家族史阳性组与阴性组进行分析,采用GA(遗传算法)模型算法选取差异蛋白,识别率为82.62% ;准确性为家族史阳性组69.23%,家族史阴性组96% ;预测能力为61.89% ;采用SNN(遗传算法)选取差异蛋白,食管癌家族史阳性组及阴性组识别率和准确性均为100%,预测能力为53.25%.结论 应用ClinProt 系统未检测到与食管癌家族史相关的特异性蛋白质,推测食管发生癌变后所产生的反应蛋白可能与食管癌家族史无明显相关性.要寻找食管癌发生及家族聚集的原因,还需要对更多因素进行进一步分析、检测以及大样本的分子流行病学研究.
    목적 심조가능여식관암환자식관암가족사상관적혈청표지물.방법 수집림주급기주변식관암고발구식관암가족사양성식관암환자28 례화식관암가족사음성식관암환자38 례혈청양본,경Clinprot 자주순화、기질보조격광해석전리비행시간질보(MALDI-TOF-MS )분석건립상응적단백질지문도보,응용ClinProTools 생물신식학방법 연구기혈청단백표체보.비교식관암가족사양성화음성적식관암환자혈청단백표체보,사선출가능여식관암가족사상관적차이단백.매조양품채용sigma 혈청진행비간중복성검측.결과 평균CV 치위0.232 ;재상대분자질량800 ～ 10 000 범위내,공검측도가족사양성여음성식관암환자혈청차이단백101 개.선취조합분조능력최호적5 개질하비(M /Z)분별위5 248.24 、5 905.05 、2 023.12 、2 953.07 、4 467.16 적단백봉건립모형병험증,현시식관암가족사양성조화음성조적혈청차이단백표체무현저성차이(P＞ 0.05).대식관암가족사양성조여음성조진행분석,채용GA(유전산법)모형산법선취차이단백,식별솔위82.62% ;준학성위가족사양성조69.23%,가족사음성조96% ;예측능력위61.89% ;채용SNN(유전산법)선취차이단백,식관암가족사양성조급음성조식별솔화준학성균위100%,예측능력위53.25%.결론 응용ClinProt 계통미검측도여식관암가족사상관적특이성단백질,추측식관발생암변후소산생적반응단백가능여식관암가족사무명현상관성.요심조식관암발생급가족취집적원인,환수요대경다인소진행진일보분석、검측이급대양본적분자류행병학연구.
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