天然产物研究与开发
天然產物研究與開髮
천연산물연구여개발
NATURAL PRODUCT RESEARCH AND DEVELOPMENT
2013年
9期
1175-1179
,共5页
李云双%周虹%钟德馨%方袁梦梦%王万军%廖海%周嘉裕
李雲雙%週虹%鐘德馨%方袁夢夢%王萬軍%廖海%週嘉裕
리운쌍%주홍%종덕형%방원몽몽%왕만군%료해%주가유
查尔酮合成酶%同源模建%分子对接%决明%类黄酮
查爾酮閤成酶%同源模建%分子對接%決明%類黃酮
사이동합성매%동원모건%분자대접%결명%류황동
Chalcone synthase%homology modeling%molecular docking%Senna tora%flavonoid
查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是植物中类黄酮生物合成途径的关键酶,其催化对-香豆酰辅酶A和丙二酸单酰辅酶A发生缩合反应.本研究以苜蓿CHS的晶体为模板,利用同源建模构建决明CHS的三维模型.经过动力学优化后,决明CHS的三维模型与苜蓿CHS的结构极为相似,主要由α-螺旋和β-折叠构成,其中有13个α螺旋,占32.82％,15个β折叠,占19.23％,无规则卷曲占47.95％.模型验证结果表明决明CHS的三维模型具有合理的立体化学性质与氨基酸相容性.决明CHS含有两个重要的结构域:对-香豆酰辅酶A结合域与丙二酸单酰辅酶A结合域.决明CHS与对-香豆酰辅酶A、丙二酸单酰辅酶A的结合主要通过氢键与范德华力.决明CHS中Cys164、His303与活性中心的H2O能够形成电子传递体系,参与对-香豆酰辅酶A形成CHS-对-香豆酰基中间产物.本研究结果为利用此类CHS三维模型研究其催化机理和分子工程改造奠定基础.
查爾酮閤成酶(chalcone synthase,CHS)是植物中類黃酮生物閤成途徑的關鍵酶,其催化對-香豆酰輔酶A和丙二痠單酰輔酶A髮生縮閤反應.本研究以苜蓿CHS的晶體為模闆,利用同源建模構建決明CHS的三維模型.經過動力學優化後,決明CHS的三維模型與苜蓿CHS的結構極為相似,主要由α-螺鏇和β-摺疊構成,其中有13箇α螺鏇,佔32.82％,15箇β摺疊,佔19.23％,無規則捲麯佔47.95％.模型驗證結果錶明決明CHS的三維模型具有閤理的立體化學性質與氨基痠相容性.決明CHS含有兩箇重要的結構域:對-香豆酰輔酶A結閤域與丙二痠單酰輔酶A結閤域.決明CHS與對-香豆酰輔酶A、丙二痠單酰輔酶A的結閤主要通過氫鍵與範德華力.決明CHS中Cys164、His303與活性中心的H2O能夠形成電子傳遞體繫,參與對-香豆酰輔酶A形成CHS-對-香豆酰基中間產物.本研究結果為利用此類CHS三維模型研究其催化機理和分子工程改造奠定基礎.
사이동합성매(chalcone synthase,CHS)시식물중류황동생물합성도경적관건매,기최화대-향두선보매A화병이산단선보매A발생축합반응.본연구이목숙CHS적정체위모판,이용동원건모구건결명CHS적삼유모형.경과동역학우화후,결명CHS적삼유모형여목숙CHS적결구겁위상사,주요유α-라선화β-절첩구성,기중유13개α라선,점32.82％,15개β절첩,점19.23％,무규칙권곡점47.95％.모형험증결과표명결명CHS적삼유모형구유합리적입체화학성질여안기산상용성.결명CHS함유량개중요적결구역:대-향두선보매A결합역여병이산단선보매A결합역.결명CHS여대-향두선보매A、병이산단선보매A적결합주요통과경건여범덕화력.결명CHS중Cys164、His303여활성중심적H2O능구형성전자전체체계,삼여대-향두선보매A형성CHS-대-향두선기중간산물.본연구결과위이용차류CHS삼유모형연구기최화궤리화분자공정개조전정기출.
