浙江海洋学院学报(自然科学版)
浙江海洋學院學報(自然科學版)
절강해양학원학보(자연과학판)
JOURNAL OF ZHEJIANG OCEAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2013年
1期
6-9
,共4页
李鹏飞%朱文斌%贺舟挺%徐开达%薛利建%张洪亮
李鵬飛%硃文斌%賀舟挺%徐開達%薛利建%張洪亮
리붕비%주문빈%하주정%서개체%설리건%장홍량
东海%带鱼%DNA条形编码%CO Ⅰ%遗传多样性
東海%帶魚%DNA條形編碼%CO Ⅰ%遺傳多樣性
동해%대어%DNA조형편마%CO Ⅰ%유전다양성
采用聚合酶链反应(PCR)技术对浙江近海水域带鱼群体(n=15)的mtDNA CO Ⅰ基因序列进行扩增,获得了大小约为650 bp的扩增产物.对PCR产物进行双向测序,得到了609 bp的基因片段(除去两端的部分序列),获得了带鱼的DNA条形编码.用DNAMAN软件进行了排序比较发现,东海带鱼的CO Ⅰ基因序列同源性高达99.69%;用DNASP软件分析得知,15个序列共有10个单倍型(在GenBank登录号:GU970070-GU970075,GU970079-GU970082),在15个个体中,共检测到13个变异位点,包括11个转换和2个颠换位点.运用MEGA软件计算出了不同个体间的遗传距离,并据此构建了UPGMA和NJ系统树.用DNASP软件计算出的多态位点数为13、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数分别为0.005 13和3.124.研究结果表明,东海带鱼的COI基因个体变异程度比较小,对研究带鱼的种群结构和不同地理种群的遗传分化具有一定的应用价值.
採用聚閤酶鏈反應(PCR)技術對浙江近海水域帶魚群體(n=15)的mtDNA CO Ⅰ基因序列進行擴增,穫得瞭大小約為650 bp的擴增產物.對PCR產物進行雙嚮測序,得到瞭609 bp的基因片段(除去兩耑的部分序列),穫得瞭帶魚的DNA條形編碼.用DNAMAN軟件進行瞭排序比較髮現,東海帶魚的CO Ⅰ基因序列同源性高達99.69%;用DNASP軟件分析得知,15箇序列共有10箇單倍型(在GenBank登錄號:GU970070-GU970075,GU970079-GU970082),在15箇箇體中,共檢測到13箇變異位點,包括11箇轉換和2箇顛換位點.運用MEGA軟件計算齣瞭不同箇體間的遺傳距離,併據此構建瞭UPGMA和NJ繫統樹.用DNASP軟件計算齣的多態位點數為13、覈苷痠多樣性指數和平均覈苷痠差異數分彆為0.005 13和3.124.研究結果錶明,東海帶魚的COI基因箇體變異程度比較小,對研究帶魚的種群結構和不同地理種群的遺傳分化具有一定的應用價值.
채용취합매련반응(PCR)기술대절강근해수역대어군체(n=15)적mtDNA CO Ⅰ기인서렬진행확증,획득료대소약위650 bp적확증산물.대PCR산물진행쌍향측서,득도료609 bp적기인편단(제거량단적부분서렬),획득료대어적DNA조형편마.용DNAMAN연건진행료배서비교발현,동해대어적CO Ⅰ기인서렬동원성고체99.69%;용DNASP연건분석득지,15개서렬공유10개단배형(재GenBank등록호:GU970070-GU970075,GU970079-GU970082),재15개개체중,공검측도13개변이위점,포괄11개전환화2개전환위점.운용MEGA연건계산출료불동개체간적유전거리,병거차구건료UPGMA화NJ계통수.용DNASP연건계산출적다태위점수위13、핵감산다양성지수화평균핵감산차이수분별위0.005 13화3.124.연구결과표명,동해대어적COI기인개체변이정도비교소,대연구대어적충군결구화불동지리충군적유전분화구유일정적응용개치.