遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2013年
3期
333-342
,共10页
张凡%林爱华%林美华%丁元林%饶绍奇
張凡%林愛華%林美華%丁元林%饒紹奇
장범%림애화%림미화%정원림%요소기
癌症%基因多效性%双聚类%基因功能模块
癌癥%基因多效性%雙聚類%基因功能模塊
암증%기인다효성%쌍취류%기인공능모괴
基因多效性是癌症遗传机制中的普遍现象,但罕见系统性的分析.文章提出采用双聚类挖掘基因功能模块的新思路探索癌症的共享分子机制和不同癌症间的关系.获取20种癌症的基因表达数据,应用改良t检验和倍数法筛选出至少在两种癌症中差异表达的基因,得到10417×20的数据矩阵；采用双聚类方法获得22个癌症共享的基因簇；进一步富集分析得到17个基因功能模块(Bonferroni校正后P＜0.05),主要参与有丝分裂染色单体分离的调控、细胞分化、免疫和炎症反应、胶原纤维组织等生物过程；主要执行ATP结合和微管活动、MHC Ⅱ类受体活性、肽链内切酶抑制活性等分子功能；活动区域主要在细胞骨架、染色体、MHCⅡ蛋白质复合体、中间丝蛋白、胶原纤维等.基于模块构建癌症相关网络,显示胃癌、卵巢腺癌、宫颈鳞癌和间皮瘤等之间相关程度较高,而两种血液系统癌症(急性髓细胞性白血病与多发性骨髓瘤)分子机制与其他癌症存在较大差异.可见癌症共享的基因功能模块与多种生物机制有关,癌症之间相似性可能与组织起源、共同的致癌机制等有关.文章提出的基因多效性分析方法有助于解释人类复杂性疾病的共享分子机制.
基因多效性是癌癥遺傳機製中的普遍現象,但罕見繫統性的分析.文章提齣採用雙聚類挖掘基因功能模塊的新思路探索癌癥的共享分子機製和不同癌癥間的關繫.穫取20種癌癥的基因錶達數據,應用改良t檢驗和倍數法篩選齣至少在兩種癌癥中差異錶達的基因,得到10417×20的數據矩陣；採用雙聚類方法穫得22箇癌癥共享的基因簇；進一步富集分析得到17箇基因功能模塊(Bonferroni校正後P＜0.05),主要參與有絲分裂染色單體分離的調控、細胞分化、免疫和炎癥反應、膠原纖維組織等生物過程；主要執行ATP結閤和微管活動、MHC Ⅱ類受體活性、肽鏈內切酶抑製活性等分子功能；活動區域主要在細胞骨架、染色體、MHCⅡ蛋白質複閤體、中間絲蛋白、膠原纖維等.基于模塊構建癌癥相關網絡,顯示胃癌、卵巢腺癌、宮頸鱗癌和間皮瘤等之間相關程度較高,而兩種血液繫統癌癥(急性髓細胞性白血病與多髮性骨髓瘤)分子機製與其他癌癥存在較大差異.可見癌癥共享的基因功能模塊與多種生物機製有關,癌癥之間相似性可能與組織起源、共同的緻癌機製等有關.文章提齣的基因多效性分析方法有助于解釋人類複雜性疾病的共享分子機製.
기인다효성시암증유전궤제중적보편현상,단한견계통성적분석.문장제출채용쌍취류알굴기인공능모괴적신사로탐색암증적공향분자궤제화불동암증간적관계.획취20충암증적기인표체수거,응용개량t검험화배수법사선출지소재량충암증중차이표체적기인,득도10417×20적수거구진；채용쌍취류방법획득22개암증공향적기인족；진일보부집분석득도17개기인공능모괴(Bonferroni교정후P＜0.05),주요삼여유사분렬염색단체분리적조공、세포분화、면역화염증반응、효원섬유조직등생물과정；주요집행ATP결합화미관활동、MHC Ⅱ류수체활성、태련내절매억제활성등분자공능；활동구역주요재세포골가、염색체、MHCⅡ단백질복합체、중간사단백、효원섬유등.기우모괴구건암증상관망락,현시위암、란소선암、궁경린암화간피류등지간상관정도교고,이량충혈액계통암증(급성수세포성백혈병여다발성골수류)분자궤제여기타암증존재교대차이.가견암증공향적기인공능모괴여다충생물궤제유관,암증지간상사성가능여조직기원、공동적치암궤제등유관.문장제출적기인다효성분석방법유조우해석인류복잡성질병적공향분자궤제.
