计算机应用研究
計算機應用研究
계산궤응용연구
APPLICATION RESEARCH OF COMPUTERS
2012年
11期
4087-4092
,共6页
基因表达数据%双聚类%差异共表达
基因錶達數據%雙聚類%差異共錶達
기인표체수거%쌍취류%차이공표체
双聚类是一种可以同时在基因和条件两个维度上分析基因表达数据的方法,它可以找出在部分条件下具有相似表达趋势的基因.已有的方法都是从一个数据集中挖掘双聚类.从生物意义上分析,从不同基因表达数据集中挖掘差异表达双聚类可以发现具有生物意义的转录因子等信息.因此,提出一种挖掘不同数据集上差异共表达双聚类的算法——DiCluster.该算法采用深度优先基因扩展方法,并引入了剪枝策略,有效挖掘最大差异表达双聚类.实验结果表明,DiCluster不仅比已有算法具有更高的效率,而且挖掘出的结果具有更好的统计学和生物学意义.
雙聚類是一種可以同時在基因和條件兩箇維度上分析基因錶達數據的方法,它可以找齣在部分條件下具有相似錶達趨勢的基因.已有的方法都是從一箇數據集中挖掘雙聚類.從生物意義上分析,從不同基因錶達數據集中挖掘差異錶達雙聚類可以髮現具有生物意義的轉錄因子等信息.因此,提齣一種挖掘不同數據集上差異共錶達雙聚類的算法——DiCluster.該算法採用深度優先基因擴展方法,併引入瞭剪枝策略,有效挖掘最大差異錶達雙聚類.實驗結果錶明,DiCluster不僅比已有算法具有更高的效率,而且挖掘齣的結果具有更好的統計學和生物學意義.
쌍취류시일충가이동시재기인화조건량개유도상분석기인표체수거적방법,타가이조출재부분조건하구유상사표체추세적기인.이유적방법도시종일개수거집중알굴쌍취류.종생물의의상분석,종불동기인표체수거집중알굴차이표체쌍취류가이발현구유생물의의적전록인자등신식.인차,제출일충알굴불동수거집상차이공표체쌍취류적산법——DiCluster.해산법채용심도우선기인확전방법,병인입료전지책략,유효알굴최대차이표체쌍취류.실험결과표명,DiCluster불부비이유산법구유경고적효솔,이차알굴출적결과구유경호적통계학화생물학의의.
