计算机应用研究
計算機應用研究
계산궤응용연구
APPLICATION RESEARCH OF COMPUTERS
2012年
11期
4060-4063,4078
,共5页
李晶%尚学群%郭阳%李晓园
李晶%尚學群%郭暘%李曉園
리정%상학군%곽양%리효완
蛋白质交互网络%链接预测%权值网络%相关节点集%剪枝
蛋白質交互網絡%鏈接預測%權值網絡%相關節點集%剪枝
단백질교호망락%련접예측%권치망락%상관절점집%전지
当前可用的生物数据在不断地迅速增长,仍有很多生物信息如蛋白质交互信息(protein-protein interaction,PPI)还未被发现,而这些潜在的或未知的信息对生物过程的研究是至关重要的.近年来,对未知生物信息的挖掘和研究吸引了很多人的关注.通过实验检测方法来发现这些信息是非常耗时耗力的,所以链接预测成为一种新的挖掘这些信息的指导方法.基于蛋白质交互网络并融合了基因表达数据信息,从拓扑和基因表达两个方面的信息来构建PPI权值网络,提出了一种在权值网络中基于相似度比较的链接预测的新方法来预测PPI网络中未知的交互信息.使用MIPS数据库评估了实验结果,表明了该算法有很好的准确率和良好的性能.
噹前可用的生物數據在不斷地迅速增長,仍有很多生物信息如蛋白質交互信息(protein-protein interaction,PPI)還未被髮現,而這些潛在的或未知的信息對生物過程的研究是至關重要的.近年來,對未知生物信息的挖掘和研究吸引瞭很多人的關註.通過實驗檢測方法來髮現這些信息是非常耗時耗力的,所以鏈接預測成為一種新的挖掘這些信息的指導方法.基于蛋白質交互網絡併融閤瞭基因錶達數據信息,從拓撲和基因錶達兩箇方麵的信息來構建PPI權值網絡,提齣瞭一種在權值網絡中基于相似度比較的鏈接預測的新方法來預測PPI網絡中未知的交互信息.使用MIPS數據庫評估瞭實驗結果,錶明瞭該算法有很好的準確率和良好的性能.
당전가용적생물수거재불단지신속증장,잉유흔다생물신식여단백질교호신식(protein-protein interaction,PPI)환미피발현,이저사잠재적혹미지적신식대생물과정적연구시지관중요적.근년래,대미지생물신식적알굴화연구흡인료흔다인적관주.통과실험검측방법래발현저사신식시비상모시모력적,소이련접예측성위일충신적알굴저사신식적지도방법.기우단백질교호망락병융합료기인표체수거신식,종탁복화기인표체량개방면적신식래구건PPI권치망락,제출료일충재권치망락중기우상사도비교적련접예측적신방법래예측PPI망락중미지적교호신식.사용MIPS수거고평고료실험결과,표명료해산법유흔호적준학솔화량호적성능.