江苏农业学报
江囌農業學報
강소농업학보
JIANGSU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
6期
1445-1450
,共6页
陈亚辉%朱海军%生静雅%张普娟%鲍瑾%刘广勤
陳亞輝%硃海軍%生靜雅%張普娟%鮑瑾%劉廣勤
진아휘%주해군%생정아%장보연%포근%류엄근
DNA条形码%美国山核桃%品种鉴定
DNA條形碼%美國山覈桃%品種鑒定
DNA조형마%미국산핵도%품충감정
DNA barcode%pecan%identification of variety
选择ITS、ITS2、psbA-trnH、matK 4条序列进行评价,以扩增及测序成功率、变异位点数和k-2-p距离等指标评价各序列的鉴定能力.此外,基于MEGA5分析不同品种美国山核桃序列种间K2P遗传距离并构建NJ树.结果显示:不同品种美国山核桃4条序列的扩增及测序成功率扩增均为100%.不同品种的ITS2和psbA-tmH序列一致性为100%,而ITS和matK序列的一致性分别为99.32%和99.95%,两者均存在较多的变异位点,可以有效地区分美国山核桃不同品种.因此,ITS和matK序列可以作为鉴定美国山核桃不同品种的优势条形码组合.
選擇ITS、ITS2、psbA-trnH、matK 4條序列進行評價,以擴增及測序成功率、變異位點數和k-2-p距離等指標評價各序列的鑒定能力.此外,基于MEGA5分析不同品種美國山覈桃序列種間K2P遺傳距離併構建NJ樹.結果顯示:不同品種美國山覈桃4條序列的擴增及測序成功率擴增均為100%.不同品種的ITS2和psbA-tmH序列一緻性為100%,而ITS和matK序列的一緻性分彆為99.32%和99.95%,兩者均存在較多的變異位點,可以有效地區分美國山覈桃不同品種.因此,ITS和matK序列可以作為鑒定美國山覈桃不同品種的優勢條形碼組閤.
선택ITS、ITS2、psbA-trnH、matK 4조서렬진행평개,이확증급측서성공솔、변이위점수화k-2-p거리등지표평개각서렬적감정능력.차외,기우MEGA5분석불동품충미국산핵도서렬충간K2P유전거리병구건NJ수.결과현시:불동품충미국산핵도4조서렬적확증급측서성공솔확증균위100%.불동품충적ITS2화psbA-tmH서렬일치성위100%,이ITS화matK서렬적일치성분별위99.32%화99.95%,량자균존재교다적변이위점,가이유효지구분미국산핵도불동품충.인차,ITS화matK서렬가이작위감정미국산핵도불동품충적우세조형마조합.