农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2012年
10期
1143-1149
,共7页
李树秀%张朝红%巩培杰%杨堃%张旭彤%王跃进
李樹秀%張朝紅%鞏培傑%楊堃%張旭彤%王躍進
리수수%장조홍%공배걸%양곤%장욱동%왕약진
WRKY%胚珠败育%葡萄%相关序列扩增多态性(SRAP)%基因克隆%表达分析
WRKY%胚珠敗育%葡萄%相關序列擴增多態性(SRAP)%基因剋隆%錶達分析
WRKY%배주패육%포도%상관서렬확증다태성(SRAP)%기인극륭%표체분석
WRKY转录因子是植物特有的一类超家族转录因子,在植物的生长、发育和衰老过程中都有WRKY转录因子的参与.本研究利用SRAP-cDNA技术,以无核葡萄(Vitis vinifera)品种无核白胚珠各发育时期的cDNA为材料,克隆获得了311 bp的差异表达片段,进一步在有核葡萄(V.vinifera)品种黑比诺胚珠中进行验证.BLASTn分析表明,差异表达片段为葡萄基因组预测的WRKY20基因序列(XM_002272334.2)的部分序列.以序列XM 002272334.2为模版设计引物,通过RT-PCR技术在无核白胚珠cDNA中克隆到一个长1796 bp的同源序列,其ORF为1653 bp,编码550个氨基酸,命名为VvWRKY20(GenBank登录号:JQ782602).生物信息学分析表明,Vv WRKY20含两个WRKY保守结构域,两个C2H2锌指结构域,两个DNA结合位点,为WRKY家族中的Ⅰ类成员.其分子量为60140.4D,等电点为6.10,不稳定系数为51.01,属于不稳定蛋白.实时荧光定量PCR分析,该基因在无核白胚珠发育过程中表达量大且变化十分很明显,最大值与最小值之比为17.56,在有核品种黑比诺中,表达较低且表达水平保持相对稳定,最大值与最小值之比仅为2.52.在同一发育时期,该基因在无核白中的表达量也远高于在黑比诺葡萄中的表达量,10d时为15.77倍,30 d时达到229.12倍.有核与无核品种Vv WRKY20基因表达的差异表明,该基因可能参与无核葡萄胚珠败育.研究结果为进一步研究葡萄胚珠败育机制提供基础资料.
WRKY轉錄因子是植物特有的一類超傢族轉錄因子,在植物的生長、髮育和衰老過程中都有WRKY轉錄因子的參與.本研究利用SRAP-cDNA技術,以無覈葡萄(Vitis vinifera)品種無覈白胚珠各髮育時期的cDNA為材料,剋隆穫得瞭311 bp的差異錶達片段,進一步在有覈葡萄(V.vinifera)品種黑比諾胚珠中進行驗證.BLASTn分析錶明,差異錶達片段為葡萄基因組預測的WRKY20基因序列(XM_002272334.2)的部分序列.以序列XM 002272334.2為模版設計引物,通過RT-PCR技術在無覈白胚珠cDNA中剋隆到一箇長1796 bp的同源序列,其ORF為1653 bp,編碼550箇氨基痠,命名為VvWRKY20(GenBank登錄號:JQ782602).生物信息學分析錶明,Vv WRKY20含兩箇WRKY保守結構域,兩箇C2H2鋅指結構域,兩箇DNA結閤位點,為WRKY傢族中的Ⅰ類成員.其分子量為60140.4D,等電點為6.10,不穩定繫數為51.01,屬于不穩定蛋白.實時熒光定量PCR分析,該基因在無覈白胚珠髮育過程中錶達量大且變化十分很明顯,最大值與最小值之比為17.56,在有覈品種黑比諾中,錶達較低且錶達水平保持相對穩定,最大值與最小值之比僅為2.52.在同一髮育時期,該基因在無覈白中的錶達量也遠高于在黑比諾葡萄中的錶達量,10d時為15.77倍,30 d時達到229.12倍.有覈與無覈品種Vv WRKY20基因錶達的差異錶明,該基因可能參與無覈葡萄胚珠敗育.研究結果為進一步研究葡萄胚珠敗育機製提供基礎資料.
WRKY전록인자시식물특유적일류초가족전록인자,재식물적생장、발육화쇠로과정중도유WRKY전록인자적삼여.본연구이용SRAP-cDNA기술,이무핵포도(Vitis vinifera)품충무핵백배주각발육시기적cDNA위재료,극륭획득료311 bp적차이표체편단,진일보재유핵포도(V.vinifera)품충흑비낙배주중진행험증.BLASTn분석표명,차이표체편단위포도기인조예측적WRKY20기인서렬(XM_002272334.2)적부분서렬.이서렬XM 002272334.2위모판설계인물,통과RT-PCR기술재무핵백배주cDNA중극륭도일개장1796 bp적동원서렬,기ORF위1653 bp,편마550개안기산,명명위VvWRKY20(GenBank등록호:JQ782602).생물신식학분석표명,Vv WRKY20함량개WRKY보수결구역,량개C2H2자지결구역,량개DNA결합위점,위WRKY가족중적Ⅰ류성원.기분자량위60140.4D,등전점위6.10,불은정계수위51.01,속우불은정단백.실시형광정량PCR분석,해기인재무핵백배주발육과정중표체량대차변화십분흔명현,최대치여최소치지비위17.56,재유핵품충흑비낙중,표체교저차표체수평보지상대은정,최대치여최소치지비부위2.52.재동일발육시기,해기인재무핵백중적표체량야원고우재흑비낙포도중적표체량,10d시위15.77배,30 d시체도229.12배.유핵여무핵품충Vv WRKY20기인표체적차이표명,해기인가능삼여무핵포도배주패육.연구결과위진일보연구포도배주패육궤제제공기출자료.