CAJ | 학술논문

通过生物信息学方法,比较分析了已登录到GenBank中的6条石斑鱼和1条豹纹鳃棘鲈的线粒体基因组序列,初步揭示了石斑鱼属线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因、差异位点、选择压力及系统发育等信息.结果表明:1)与大多数脊椎动物一样,石斑鱼属鱼类线粒体基因组均编码37个基因,基因排列顺序与其它硬骨鱼类一致,其中,基因差异位点比例最大为ND6(33.9％),16SrRNA的差异位点比例最小(13.5％)；2)6条石斑鱼线粒体基因组中,所有13个蛋白质编码基因的Tajima's D检测均为不显著的负值,且Ka/Ks均远小于1,都显示出较强的净化选择作用；3)结合分子系统树的置信度和与序列的信息量,对石斑鱼线粒体13个蛋白质编码基因在属内种间的系统进化分析能力进行了评估,结果表明Cytb和ND2基因是理想的分子标记.
통과생물신식학방법,비교분석료이등록도GenBank중적6조석반어화1조표문새극로적선립체기인조서렬,초보게시료석반어속선립체기인조적기본특정、단백질편마기인、차이위점、선택압력급계통발육등신식.결과표명:1)여대다수척추동물일양,석반어속어류선립체기인조균편마37개기인,기인배렬순서여기타경골어류일치,기중,기인차이위점비례최대위ND6(33.9％),16SrRNA적차이위점비례최소(13.5％)；2)6조석반어선립체기인조중,소유13개단백질편마기인적Tajima's D검측균위불현저적부치,차Ka/Ks균원소우1,도현시출교강적정화선택작용；3)결합분자계통수적치신도화여서렬적신식량,대석반어선립체13개단백질편마기인재속내충간적계통진화분석능력진행료평고,결과표명Cytb화ND2기인시이상적분자표기.