中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
30期
201-207
,共7页
陈孝仁%张博月%邢玉平%童蕴慧%徐敬友
陳孝仁%張博月%邢玉平%童蘊慧%徐敬友
진효인%장박월%형옥평%동온혜%서경우
内参基因%持家基因%恶疫霉%实时定量RT-PCR%草莓
內參基因%持傢基因%噁疫黴%實時定量RT-PCR%草莓
내삼기인%지가기인%악역매%실시정량RT-PCR%초매
为选择合适的内参基因用于分析植物病原卵菌恶疫霉(Phytophthora cactorum)的基因表达情况,本研究利用实时定量RT-PCR分析持家基因Ubc、Tub-b、WS21和WS41在恶疫霉生长发育阶段和侵染草莓阶段的表达差异,并利用软件geNorm、NormFinder和BestKeeper比较其表达稳定性.结果表明:基于公共数据库序列和其他疫霉菌同源序列设计的持家基因引物在恶疫霉中具有良好的扩增效率、反应有效性和特异性.通过分析,发现在恶疫霉的不同生长发育阶段(菌丝生长、游动孢子囊、游动孢子和休止孢萌发)和侵染草莓阶段(接种后3、5、7天),表现最为稳定的是Ubc基因.当使用多个内参基因时,Ubc和WS41是最适合校正恶疫霉基因表达数据的内参基因组合.本研究结果为利用实时定量RT-PCR准确分析恶疫霉基因相对表达量提供了重要的内参基因,也为其他疫霉菌的基因表达研究提供了有价值的参考.
為選擇閤適的內參基因用于分析植物病原卵菌噁疫黴(Phytophthora cactorum)的基因錶達情況,本研究利用實時定量RT-PCR分析持傢基因Ubc、Tub-b、WS21和WS41在噁疫黴生長髮育階段和侵染草莓階段的錶達差異,併利用軟件geNorm、NormFinder和BestKeeper比較其錶達穩定性.結果錶明:基于公共數據庫序列和其他疫黴菌同源序列設計的持傢基因引物在噁疫黴中具有良好的擴增效率、反應有效性和特異性.通過分析,髮現在噁疫黴的不同生長髮育階段(菌絲生長、遊動孢子囊、遊動孢子和休止孢萌髮)和侵染草莓階段(接種後3、5、7天),錶現最為穩定的是Ubc基因.噹使用多箇內參基因時,Ubc和WS41是最適閤校正噁疫黴基因錶達數據的內參基因組閤.本研究結果為利用實時定量RT-PCR準確分析噁疫黴基因相對錶達量提供瞭重要的內參基因,也為其他疫黴菌的基因錶達研究提供瞭有價值的參攷.
위선택합괄적내삼기인용우분석식물병원란균악역매(Phytophthora cactorum)적기인표체정황,본연구이용실시정량RT-PCR분석지가기인Ubc、Tub-b、WS21화WS41재악역매생장발육계단화침염초매계단적표체차이,병이용연건geNorm、NormFinder화BestKeeper비교기표체은정성.결과표명:기우공공수거고서렬화기타역매균동원서렬설계적지가기인인물재악역매중구유량호적확증효솔、반응유효성화특이성.통과분석,발현재악역매적불동생장발육계단(균사생장、유동포자낭、유동포자화휴지포맹발)화침염초매계단(접충후3、5、7천),표현최위은정적시Ubc기인.당사용다개내삼기인시,Ubc화WS41시최괄합교정악역매기인표체수거적내삼기인조합.본연구결과위이용실시정량RT-PCR준학분석악역매기인상대표체량제공료중요적내삼기인,야위기타역매균적기인표체연구제공료유개치적삼고.
