中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
30期
184-190
,共7页
张何芳%陈新%卢诚%章伟雄%王文泉
張何芳%陳新%盧誠%章偉雄%王文泉
장하방%진신%로성%장위웅%왕문천
木薯%miRNA%Solexa测序
木藷%miRNA%Solexa測序
목서%miRNA%Solexa측서
为了发掘木薯中的microRNAs (miRNAs),了解其在木薯中的调控机制,利用Solexa测序技术在木薯中发现了大量的miRNAs,并利用一种新的miRNA定量检测技术(Multiplexed RT法)对其进行实验验证.通过对构建的3个小RNA文库进行Solexa测序与生物信息学分析,最终获得19个家族93个保守的miRNA和74个新的miRNA,实验验证了测序获得的83个miRNA.在Arg7块根中特异表达的有6个miRNA,分别为miR172d、miR396c、miR398a、miR398b、miR399e、miR399f,叶片中特异表达的有13个,须根中特异表达的有3个,这些miRNAs将为深入了解木薯块根发育和淀粉累积机理提供了一个新的视角.
為瞭髮掘木藷中的microRNAs (miRNAs),瞭解其在木藷中的調控機製,利用Solexa測序技術在木藷中髮現瞭大量的miRNAs,併利用一種新的miRNA定量檢測技術(Multiplexed RT法)對其進行實驗驗證.通過對構建的3箇小RNA文庫進行Solexa測序與生物信息學分析,最終穫得19箇傢族93箇保守的miRNA和74箇新的miRNA,實驗驗證瞭測序穫得的83箇miRNA.在Arg7塊根中特異錶達的有6箇miRNA,分彆為miR172d、miR396c、miR398a、miR398b、miR399e、miR399f,葉片中特異錶達的有13箇,鬚根中特異錶達的有3箇,這些miRNAs將為深入瞭解木藷塊根髮育和澱粉纍積機理提供瞭一箇新的視角.
위료발굴목서중적microRNAs (miRNAs),료해기재목서중적조공궤제,이용Solexa측서기술재목서중발현료대량적miRNAs,병이용일충신적miRNA정량검측기술(Multiplexed RT법)대기진행실험험증.통과대구건적3개소RNA문고진행Solexa측서여생물신식학분석,최종획득19개가족93개보수적miRNA화74개신적miRNA,실험험증료측서획득적83개miRNA.재Arg7괴근중특이표체적유6개miRNA,분별위miR172d、miR396c、miR398a、miR398b、miR399e、miR399f,협편중특이표체적유13개,수근중특이표체적유3개,저사miRNAs장위심입료해목서괴근발육화정분루적궤리제공료일개신적시각.
