军事医学
軍事醫學
군사의학
BULLETIN OF THE ACADEMY OF MILITARY MEDICAL SCIENCES
2013年
1期
69-72
,共4页
涂智杰%胡芹%曹金萍%蔡年娥%吴建英%宋建新%余慧宏
塗智傑%鬍芹%曹金萍%蔡年娥%吳建英%宋建新%餘慧宏
도지걸%호근%조금평%채년아%오건영%송건신%여혜굉
肠道病毒71型%基因型%手足口病%序列分析%基因组
腸道病毒71型%基因型%手足口病%序列分析%基因組
장도병독71형%기인형%수족구병%서렬분석%기인조
目的 分析2011年景德镇地区重症手足口病患儿标本肠道病毒71型(EV71)分离株2011JDZ35全基因组序列特征.方法 采集重症手足口病患儿咽拭子标本,进行病毒分离和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增分离病毒的全基因组序列,并进行全基因组核苷酸序列测定,参考EV71 A、B、C各基因型的参考毒株和国内外分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 2011JDZ35株的基因组长度为7406 bp,其中包括5′端非编码区(5′UTR)长742 bp,病毒基因组编码区(ORF)全长6582 bp及3′端非编码区(3′UTR)长82 bp.ORF编码含2193个氨基酸残基的多聚蛋白.2011JDZ35株基因组的结构与FY08-C30-P14、EV71/Ningbo.CHN/065/2010、HZ08/Hangzhou/2008十分接近,整个基因组的核苷酸同源性分别为97.3%,97.3%,97.7%;氨基酸同源性为99.1%,99.2%,99.2%.均属于C4亚型,而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)及EV71国际标准株BrCr(U22521)差异较大,核苷酸同源性分别仅为77.5%,80.0%;氨基酸同源性为89.8%,94.8%.结论 EV71型病毒2011JDZ35株全基因组的组成和结构符合肠道病毒特征,与其他EV71型病毒具有相同的基因组结构,2011JDZ35株与中国大陆浙江宁波株亲缘关系最近,与阜阳株和杭州株等中国大陆内陆地区分离株较近,而与马来西亚、我国台湾、厦门分离株的差异较为明显,与国际标准株则有较大差异;2011JDZ35株与浙江宁波株具有共同的进化途径,推断2011JDZ35株与浙江宁波株可能共同来源于2008年中国大陆地区流行的EV71病毒株同一种系.
目的 分析2011年景德鎮地區重癥手足口病患兒標本腸道病毒71型(EV71)分離株2011JDZ35全基因組序列特徵.方法 採集重癥手足口病患兒嚥拭子標本,進行病毒分離和逆轉錄-聚閤酶鏈反應(RT-PCR)擴增分離病毒的全基因組序列,併進行全基因組覈苷痠序列測定,參攷EV71 A、B、C各基因型的參攷毒株和國內外分離毒株進行同源性分析併構建繫統髮生樹.結果 2011JDZ35株的基因組長度為7406 bp,其中包括5′耑非編碼區(5′UTR)長742 bp,病毒基因組編碼區(ORF)全長6582 bp及3′耑非編碼區(3′UTR)長82 bp.ORF編碼含2193箇氨基痠殘基的多聚蛋白.2011JDZ35株基因組的結構與FY08-C30-P14、EV71/Ningbo.CHN/065/2010、HZ08/Hangzhou/2008十分接近,整箇基因組的覈苷痠同源性分彆為97.3%,97.3%,97.7%;氨基痠同源性為99.1%,99.2%,99.2%.均屬于C4亞型,而與Cox.A16國際標準株G10(U05876)及EV71國際標準株BrCr(U22521)差異較大,覈苷痠同源性分彆僅為77.5%,80.0%;氨基痠同源性為89.8%,94.8%.結論 EV71型病毒2011JDZ35株全基因組的組成和結構符閤腸道病毒特徵,與其他EV71型病毒具有相同的基因組結構,2011JDZ35株與中國大陸浙江寧波株親緣關繫最近,與阜暘株和杭州株等中國大陸內陸地區分離株較近,而與馬來西亞、我國檯灣、廈門分離株的差異較為明顯,與國際標準株則有較大差異;2011JDZ35株與浙江寧波株具有共同的進化途徑,推斷2011JDZ35株與浙江寧波株可能共同來源于2008年中國大陸地區流行的EV71病毒株同一種繫.
목적 분석2011년경덕진지구중증수족구병환인표본장도병독71형(EV71)분리주2011JDZ35전기인조서렬특정.방법 채집중증수족구병환인인식자표본,진행병독분리화역전록-취합매련반응(RT-PCR)확증분리병독적전기인조서렬,병진행전기인조핵감산서렬측정,삼고EV71 A、B、C각기인형적삼고독주화국내외분리독주진행동원성분석병구건계통발생수.결과 2011JDZ35주적기인조장도위7406 bp,기중포괄5′단비편마구(5′UTR)장742 bp,병독기인조편마구(ORF)전장6582 bp급3′단비편마구(3′UTR)장82 bp.ORF편마함2193개안기산잔기적다취단백.2011JDZ35주기인조적결구여FY08-C30-P14、EV71/Ningbo.CHN/065/2010、HZ08/Hangzhou/2008십분접근,정개기인조적핵감산동원성분별위97.3%,97.3%,97.7%;안기산동원성위99.1%,99.2%,99.2%.균속우C4아형,이여Cox.A16국제표준주G10(U05876)급EV71국제표준주BrCr(U22521)차이교대,핵감산동원성분별부위77.5%,80.0%;안기산동원성위89.8%,94.8%.결론 EV71형병독2011JDZ35주전기인조적조성화결구부합장도병독특정,여기타EV71형병독구유상동적기인조결구,2011JDZ35주여중국대륙절강저파주친연관계최근,여부양주화항주주등중국대륙내륙지구분리주교근,이여마래서아、아국태만、하문분리주적차이교위명현,여국제표준주칙유교대차이;2011JDZ35주여절강저파주구유공동적진화도경,추단2011JDZ35주여절강저파주가능공동래원우2008년중국대륙지구류행적EV71병독주동일충계.
