数据采集与处理
數據採集與處理
수거채집여처리
JOURNAL OF DATA ACQUISITION & PROCESSING
2013年
5期
679-684
,共6页
多基因整合%一致基因%基因预测%动态规划
多基因整閤%一緻基因%基因預測%動態規劃
다기인정합%일치기인%기인예측%동태규화
integration of multiple genes%consensus gene%gene prediction%dynamic programming
针对独立基因预测算法可靠性较差的缺点,提出了真核生物多基因预测结果整合算法(Algorithm for integration of multiple eukaryotie gene prediction results,AIMEGPR).该算法在综合分析各种预测算法结果的基础上,首先用极大似然法估计各种预测算法的性能参数,然后利用这些性能参数计算基因证据区间上各个基因片段归属于各种基因元件类型的后验概率,最后采用动态规划法在基因证据区间上确定最优的一致基因结构.AIMEGPR既不需要人工定制整合规则,也不需要复杂的训练学习,因此AIMEGPR尤其在基因组新测序物种上进行编码基因注释时具有十分显著的优越性.实验结果表明,利用AIMEGPR算法对多基因预测结果整合可以明显提高一致基因的可靠性.
針對獨立基因預測算法可靠性較差的缺點,提齣瞭真覈生物多基因預測結果整閤算法(Algorithm for integration of multiple eukaryotie gene prediction results,AIMEGPR).該算法在綜閤分析各種預測算法結果的基礎上,首先用極大似然法估計各種預測算法的性能參數,然後利用這些性能參數計算基因證據區間上各箇基因片段歸屬于各種基因元件類型的後驗概率,最後採用動態規劃法在基因證據區間上確定最優的一緻基因結構.AIMEGPR既不需要人工定製整閤規則,也不需要複雜的訓練學習,因此AIMEGPR尤其在基因組新測序物種上進行編碼基因註釋時具有十分顯著的優越性.實驗結果錶明,利用AIMEGPR算法對多基因預測結果整閤可以明顯提高一緻基因的可靠性.
침대독립기인예측산법가고성교차적결점,제출료진핵생물다기인예측결과정합산법(Algorithm for integration of multiple eukaryotie gene prediction results,AIMEGPR).해산법재종합분석각충예측산법결과적기출상,수선용겁대사연법고계각충예측산법적성능삼수,연후이용저사성능삼수계산기인증거구간상각개기인편단귀속우각충기인원건류형적후험개솔,최후채용동태규화법재기인증거구간상학정최우적일치기인결구.AIMEGPR기불수요인공정제정합규칙,야불수요복잡적훈련학습,인차AIMEGPR우기재기인조신측서물충상진행편마기인주석시구유십분현저적우월성.실험결과표명,이용AIMEGPR산법대다기인예측결과정합가이명현제고일치기인적가고성.
