甘肃农业大学学报
甘肅農業大學學報
감숙농업대학학보
JOURNAL OF GANSU AGRICULTURAL UNIVERSITY
2013年
1期
80-86
,共7页
冯丹%刘柏林%王永林%张宁%文义凯%司怀军%王蒂
馮丹%劉柏林%王永林%張寧%文義凱%司懷軍%王蒂
풍단%류백림%왕영림%장저%문의개%사부군%왕체
马铃薯%乙烯响应因子%基因克隆%生物信息学%qRT-PCR
馬鈴藷%乙烯響應因子%基因剋隆%生物信息學%qRT-PCR
마령서%을희향응인자%기인극륭%생물신식학%qRT-PCR
根据番茄ERF5基因(NM_001247583.1)序列设计引物,采用RT-PCR方法得到马铃薯ERF基因的cDNA,并对其进行生物信息学及表达分析.结果表明:该cDNA全长789 bp,阅读框为732 bp,编码243个氨基酸.序列同源性分析表明该基因序列与番茄ERF5基因的序列同源性达82％,氨基酸序列同源性达70％.对该马铃薯ERF基因的氨基酸序列经BLAST进行多序列比对,发现该氨基酸序列的98～160 bp为AP2结构域,属于AP2/EREBP转录因子的EREBP亚族ERF类.蛋白质三级结构预测表明该基因的AP2结构域非常保守.对ERF基因进行荧光定量PCR分析,表明该基因可能参与了马铃薯块茎解除休眠与发芽过程的调控.
根據番茄ERF5基因(NM_001247583.1)序列設計引物,採用RT-PCR方法得到馬鈴藷ERF基因的cDNA,併對其進行生物信息學及錶達分析.結果錶明:該cDNA全長789 bp,閱讀框為732 bp,編碼243箇氨基痠.序列同源性分析錶明該基因序列與番茄ERF5基因的序列同源性達82％,氨基痠序列同源性達70％.對該馬鈴藷ERF基因的氨基痠序列經BLAST進行多序列比對,髮現該氨基痠序列的98～160 bp為AP2結構域,屬于AP2/EREBP轉錄因子的EREBP亞族ERF類.蛋白質三級結構預測錶明該基因的AP2結構域非常保守.對ERF基因進行熒光定量PCR分析,錶明該基因可能參與瞭馬鈴藷塊莖解除休眠與髮芽過程的調控.
근거번가ERF5기인(NM_001247583.1)서렬설계인물,채용RT-PCR방법득도마령서ERF기인적cDNA,병대기진행생물신식학급표체분석.결과표명:해cDNA전장789 bp,열독광위732 bp,편마243개안기산.서렬동원성분석표명해기인서렬여번가ERF5기인적서렬동원성체82％,안기산서렬동원성체70％.대해마령서ERF기인적안기산서렬경BLAST진행다서렬비대,발현해안기산서렬적98～160 bp위AP2결구역,속우AP2/EREBP전록인자적EREBP아족ERF류.단백질삼급결구예측표명해기인적AP2결구역비상보수.대ERF기인진행형광정량PCR분석,표명해기인가능삼여료마령서괴경해제휴면여발아과정적조공.
