中国畜牧兽医
中國畜牧獸醫
중국축목수의
CHINA ANIMAL HUSBANDRY & VETERINARY MEDICINE
2013年
3期
28-32
,共5页
吴正常%苏先敏%王瑾%郑先瑞%吴圣龙%包文斌
吳正常%囌先敏%王瑾%鄭先瑞%吳聖龍%包文斌
오정상%소선민%왕근%정선서%오골룡%포문빈
BPI基因%编码区%生物信息学
BPI基因%編碼區%生物信息學
BPI기인%편마구%생물신식학
本研究采用生物信息学的方法比较不同物种BPI基因编码区CDS序列,分析人、小家鼠、褐家鼠、牛、白颊长臂猿、原鸡、家兔、野猪、猕猴、家马、非洲爪蟾、毛猩猩、犬13个物种BPI基因编码区的遗传多样性,且对BPI氨基酸序列组成、信号肽、疏水性/亲水性、跨膜结构、二级结构及保守结构域进行预测分析.结果表明,在13个物种的29条BPI基因CDS序列中,共检测到532个多态位点,生成了15种单倍型,BPI基因在种群间及种群内均存在较大的遗传变异,BPI基因具有较强的密码子偏爱性.BPI蛋白理论等电点均大于7,呈碱性,N端大都有信号肽,肽链表现为亲水性,基本属于跨膜蛋白和分泌蛋白.BPI蛋白主要二级结构元件为a螺旋、β折叠和无规则卷曲,有2个保守结构域BPI1和BPI2.
本研究採用生物信息學的方法比較不同物種BPI基因編碼區CDS序列,分析人、小傢鼠、褐傢鼠、牛、白頰長臂猿、原鷄、傢兔、野豬、獼猴、傢馬、非洲爪蟾、毛猩猩、犬13箇物種BPI基因編碼區的遺傳多樣性,且對BPI氨基痠序列組成、信號肽、疏水性/親水性、跨膜結構、二級結構及保守結構域進行預測分析.結果錶明,在13箇物種的29條BPI基因CDS序列中,共檢測到532箇多態位點,生成瞭15種單倍型,BPI基因在種群間及種群內均存在較大的遺傳變異,BPI基因具有較彊的密碼子偏愛性.BPI蛋白理論等電點均大于7,呈堿性,N耑大都有信號肽,肽鏈錶現為親水性,基本屬于跨膜蛋白和分泌蛋白.BPI蛋白主要二級結構元件為a螺鏇、β摺疊和無規則捲麯,有2箇保守結構域BPI1和BPI2.
본연구채용생물신식학적방법비교불동물충BPI기인편마구CDS서렬,분석인、소가서、갈가서、우、백협장비원、원계、가토、야저、미후、가마、비주조섬、모성성、견13개물충BPI기인편마구적유전다양성,차대BPI안기산서렬조성、신호태、소수성/친수성、과막결구、이급결구급보수결구역진행예측분석.결과표명,재13개물충적29조BPI기인CDS서렬중,공검측도532개다태위점,생성료15충단배형,BPI기인재충군간급충군내균존재교대적유전변이,BPI기인구유교강적밀마자편애성.BPI단백이론등전점균대우7,정감성,N단대도유신호태,태련표현위친수성,기본속우과막단백화분비단백.BPI단백주요이급결구원건위a라선、β절첩화무규칙권곡,유2개보수결구역BPI1화BPI2.