CAJ | 학술논문

本研究克隆了水牛转录抑制因子CTCF基因序列,并运用生物信息学方法对其核苷酸序列的保守性和氨基酸的理化性质、蛋白质结构进行了系统分析,此外还对CTCF基因在水牛不同组织中的表达差异进行了检测.结果表明,应用RTPCR技术克隆获得了长2239 bp水牛CTCF基因序列,其中编码区全长2184 bp,编码727个氨基酸,理论蛋白质分子质量82.7 ku,等电点为6.57.多重序列比较分析显示,水牛CTCF核苷酸序列与牛、猪、马、人和小鼠相应序列的相似性分别为99％、96％、96％、94％和92％,结合系统进化树分析结果推测,CTCF基因在不同物种及进化的过程中具有高度的保守性.对水牛CTCF蛋白的二级和三级结构分析结果发现,其存在连续11个锌指C2H2结构,预测其为重要的DNA结合蛋白.定量表达分析结果显示,CTCF在水牛肝脏组织中相对表达量最高,大脑、肌肉和肾脏次之,卵巢和皮肤表达量较低.
본연구극륭료수우전록억제인자CTCF기인서렬,병운용생물신식학방법대기핵감산서렬적보수성화안기산적이화성질、단백질결구진행료계통분석,차외환대CTCF기인재수우불동조직중적표체차이진행료검측.결과표명,응용RTPCR기술극륭획득료장2239 bp수우CTCF기인서렬,기중편마구전장2184 bp,편마727개안기산,이론단백질분자질량82.7 ku,등전점위6.57.다중서렬비교분석현시,수우CTCF핵감산서렬여우、저、마、인화소서상응서렬적상사성분별위99％、96％、96％、94％화92％,결합계통진화수분석결과추측,CTCF기인재불동물충급진화적과정중구유고도적보수성.대수우CTCF단백적이급화삼급결구분석결과발현,기존재련속11개자지C2H2결구,예측기위중요적DNA결합단백.정량표체분석결과현시,CTCF재수우간장조직중상대표체량최고,대뇌、기육화신장차지,란소화피부표체량교저.