安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
6期
2391-2393,2470
,共4页
李晓丹%张国刚%何庆峰%闫师杰%张平平
李曉丹%張國剛%何慶峰%閆師傑%張平平
리효단%장국강%하경봉%염사걸%장평평
油葵%fad2%生物信息学%序列分析
油葵%fad2%生物信息學%序列分析
유규%fad2%생물신식학%서렬분석
该研究利用生物信息学软件对克隆得到的油葵基因fad2序列进行核苷酸结构和蛋白质结构分析,结果表明油葵中fad2基因编码382个氨基酸,含有完整的ORF框;其功能域为△-12脂肪酸去饱和酶类结构域,含有3个保守的组氨酸簇；蛋白质二级结构中包含14个α螺旋,7个β折叠,此外还含有17个具有二级结构趋势的无规则卷曲；蛋白质羧基末端以YXXKI结尾,符合Phi-X-X-K/R/D/E-Phi-COOH基序序列规则,是内质网滞留信号；从系统发育进化的角度可知油葵与橄榄的亲缘关系较近.
該研究利用生物信息學軟件對剋隆得到的油葵基因fad2序列進行覈苷痠結構和蛋白質結構分析,結果錶明油葵中fad2基因編碼382箇氨基痠,含有完整的ORF框;其功能域為△-12脂肪痠去飽和酶類結構域,含有3箇保守的組氨痠簇；蛋白質二級結構中包含14箇α螺鏇,7箇β摺疊,此外還含有17箇具有二級結構趨勢的無規則捲麯；蛋白質羧基末耑以YXXKI結尾,符閤Phi-X-X-K/R/D/E-Phi-COOH基序序列規則,是內質網滯留信號；從繫統髮育進化的角度可知油葵與橄欖的親緣關繫較近.
해연구이용생물신식학연건대극륭득도적유규기인fad2서렬진행핵감산결구화단백질결구분석,결과표명유규중fad2기인편마382개안기산,함유완정적ORF광;기공능역위△-12지방산거포화매류결구역,함유3개보수적조안산족；단백질이급결구중포함14개α라선,7개β절첩,차외환함유17개구유이급결구추세적무규칙권곡；단백질최기말단이YXXKI결미,부합Phi-X-X-K/R/D/E-Phi-COOH기서서렬규칙,시내질망체류신호；종계통발육진화적각도가지유규여감람적친연관계교근.
