宁夏医科大学学报
寧夏醫科大學學報
저하의과대학학보
JOURNAL OF NINGXIA MEDICAL COLLEGE
2014年
4期
359-363,封4
,共6页
汪超%刘爱翠%马巧丽%詹军%王振海
汪超%劉愛翠%馬巧麗%詹軍%王振海
왕초%류애취%마교려%첨군%왕진해
羊种3型%布鲁氏菌%毒力基因%全基因组测序
羊種3型%佈魯氏菌%毒力基因%全基因組測序
양충3형%포로씨균%독력기인%전기인조측서
Brucella melitensis biovar 3%Brucella%virulence genes%whole-genome sequencing
目的 从3株布鲁氏菌分离株的全基因组序列中筛选出可能导致脑损害的关键毒力基因,为后续筛选布鲁氏菌致脑损害毒力基因的研究奠定基础.方法 通过BCSP31PCR、传统生化实验对3株分离于布鲁氏菌病患者外周血中的布鲁氏菌进行鉴定分型.利用Illumina Hiseq2000平台对3株布鲁氏菌进行全基因组测序与比较基因组学分析,根据文献报道分析筛选出布鲁氏菌的经典毒力基因,通过检索NCBI核酸数据库查找出所选毒力基因的参考序列,利用所选参考序列分别与3株布鲁氏菌全基因组序列做BLAT比对分析.结果 3株布鲁氏菌经BCSP31PCR、传统生化实验鉴定为羊种3型;比较基因组分析显示3株布鲁氏菌与标准株参考序列的同源性比例均达到99.02％.BLAT比对分析发现所选毒力基因wbkA、pgm、hemolysin、hemolysin Ⅲ和Omp25在这3株布鲁氏菌全基因组序列中的比对分数均达到99％以上.结论 本研究所选取的3株羊种3型布鲁氏菌的全基因组中存在经典的毒力基因序列.
目的 從3株佈魯氏菌分離株的全基因組序列中篩選齣可能導緻腦損害的關鍵毒力基因,為後續篩選佈魯氏菌緻腦損害毒力基因的研究奠定基礎.方法 通過BCSP31PCR、傳統生化實驗對3株分離于佈魯氏菌病患者外週血中的佈魯氏菌進行鑒定分型.利用Illumina Hiseq2000平檯對3株佈魯氏菌進行全基因組測序與比較基因組學分析,根據文獻報道分析篩選齣佈魯氏菌的經典毒力基因,通過檢索NCBI覈痠數據庫查找齣所選毒力基因的參攷序列,利用所選參攷序列分彆與3株佈魯氏菌全基因組序列做BLAT比對分析.結果 3株佈魯氏菌經BCSP31PCR、傳統生化實驗鑒定為羊種3型;比較基因組分析顯示3株佈魯氏菌與標準株參攷序列的同源性比例均達到99.02％.BLAT比對分析髮現所選毒力基因wbkA、pgm、hemolysin、hemolysin Ⅲ和Omp25在這3株佈魯氏菌全基因組序列中的比對分數均達到99％以上.結論 本研究所選取的3株羊種3型佈魯氏菌的全基因組中存在經典的毒力基因序列.
목적 종3주포로씨균분리주적전기인조서렬중사선출가능도치뇌손해적관건독력기인,위후속사선포로씨균치뇌손해독력기인적연구전정기출.방법 통과BCSP31PCR、전통생화실험대3주분리우포로씨균병환자외주혈중적포로씨균진행감정분형.이용Illumina Hiseq2000평태대3주포로씨균진행전기인조측서여비교기인조학분석,근거문헌보도분석사선출포로씨균적경전독력기인,통과검색NCBI핵산수거고사조출소선독력기인적삼고서렬,이용소선삼고서렬분별여3주포로씨균전기인조서렬주BLAT비대분석.결과 3주포로씨균경BCSP31PCR、전통생화실험감정위양충3형;비교기인조분석현시3주포로씨균여표준주삼고서렬적동원성비례균체도99.02％.BLAT비대분석발현소선독력기인wbkA、pgm、hemolysin、hemolysin Ⅲ화Omp25재저3주포로씨균전기인조서렬중적비대분수균체도99％이상.결론 본연구소선취적3주양충3형포로씨균적전기인조중존재경전적독력기인서렬.
