植物保护
植物保護
식물보호
PLANT PROTECTION
2013年
1期
50-55
,共6页
庄绪静%尹姣%李克斌%曹雅忠
莊緒靜%尹姣%李剋斌%曹雅忠
장서정%윤교%리극빈%조아충
气味结合蛋白%生物信息学%同源建模%分子对接
氣味結閤蛋白%生物信息學%同源建模%分子對接
기미결합단백%생물신식학%동원건모%분자대접
探讨应用生物信息学技术预测华北大黑鳃金龟触角气味结合蛋白HoblOBP2三维结构及其与苯甲酸己酯的结合模式.利用生物信息学相关工具和网站预测HoblOBP2的基本性质,并对其三维结构进行同源建模后发现HoblOBP2的三维结构具有与昆虫普通气味结合蛋白结构的共同特点,即6个α螺旋,其中除了α2在外的5个α螺旋形成疏水结合口袋,3对二硫键起着稳定蛋白结构的作用.将苯甲酸己酯分子对接到HoblOBP2的活性区域,预测蛋白质与气味分子的结合模式,经分析可知蛋白质与气味分子主要通过范德华力和疏水作用相互影响,蛋白内部形成分子内氢键,根据蛋白与气味分子间的结合特性推测HoblOBP2与气味分子结合的三个关键结合位点分别为:LEU73,THR54和VAL137.
探討應用生物信息學技術預測華北大黑鰓金龜觸角氣味結閤蛋白HoblOBP2三維結構及其與苯甲痠己酯的結閤模式.利用生物信息學相關工具和網站預測HoblOBP2的基本性質,併對其三維結構進行同源建模後髮現HoblOBP2的三維結構具有與昆蟲普通氣味結閤蛋白結構的共同特點,即6箇α螺鏇,其中除瞭α2在外的5箇α螺鏇形成疏水結閤口袋,3對二硫鍵起著穩定蛋白結構的作用.將苯甲痠己酯分子對接到HoblOBP2的活性區域,預測蛋白質與氣味分子的結閤模式,經分析可知蛋白質與氣味分子主要通過範德華力和疏水作用相互影響,蛋白內部形成分子內氫鍵,根據蛋白與氣味分子間的結閤特性推測HoblOBP2與氣味分子結閤的三箇關鍵結閤位點分彆為:LEU73,THR54和VAL137.
탐토응용생물신식학기술예측화북대흑새금구촉각기미결합단백HoblOBP2삼유결구급기여분갑산기지적결합모식.이용생물신식학상관공구화망참예측HoblOBP2적기본성질,병대기삼유결구진행동원건모후발현HoblOBP2적삼유결구구유여곤충보통기미결합단백결구적공동특점,즉6개α라선,기중제료α2재외적5개α라선형성소수결합구대,3대이류건기착은정단백결구적작용.장분갑산기지분자대접도HoblOBP2적활성구역,예측단백질여기미분자적결합모식,경분석가지단백질여기미분자주요통과범덕화력화소수작용상호영향,단백내부형성분자내경건,근거단백여기미분자간적결합특성추측HoblOBP2여기미분자결합적삼개관건결합위점분별위:LEU73,THR54화VAL137.
