江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
12期
37-41
,共5页
马月姣%孙晓红%赵勇%卢瑛%吴启华%潘迎捷
馬月姣%孫曉紅%趙勇%盧瑛%吳啟華%潘迎捷
마월교%손효홍%조용%로영%오계화%반영첩
副溶血性弧菌%REP-PCR%ERIC-PCR%优势谱型
副溶血性弧菌%REP-PCR%ERIC-PCR%優勢譜型
부용혈성호균%REP-PCR%ERIC-PCR%우세보형
采用肠细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)2种方法,对从3种不同样品中分离得到的副溶血性弧菌进行分型分析；通过REP和ERIC-PCR指纹图谱扩增,利用NT-SYS-pc软件,并采用Dice系数对指纹图谱进行聚类分析.结果显示:55株副溶血性弧菌REP-PCR指纹图聚谱共分为3大类,其中底泥中的优势谱型为Ⅰ类型,海水中的优势谱型为Ⅱ类型,虾样品中的优势谱型为Ⅰ类型；ERIC-PCR指纹谱型也聚类为3大类,在海水和底泥中的优势谱型均为Ⅰ类型,但底泥中副溶血性弧菌多样性较海水中丰富,虾样品中副溶血性弧菌优势谱型为Ⅱ类型.表明不同样品中副溶血性弧菌优势型不同,进而推测不同类型谱型的菌株耐冷特性不同.
採用腸細菌基因外重複迴文序列擴增(REP-PCR)和腸道細菌基因間重複序列擴增(ERIC-PCR)2種方法,對從3種不同樣品中分離得到的副溶血性弧菌進行分型分析；通過REP和ERIC-PCR指紋圖譜擴增,利用NT-SYS-pc軟件,併採用Dice繫數對指紋圖譜進行聚類分析.結果顯示:55株副溶血性弧菌REP-PCR指紋圖聚譜共分為3大類,其中底泥中的優勢譜型為Ⅰ類型,海水中的優勢譜型為Ⅱ類型,蝦樣品中的優勢譜型為Ⅰ類型；ERIC-PCR指紋譜型也聚類為3大類,在海水和底泥中的優勢譜型均為Ⅰ類型,但底泥中副溶血性弧菌多樣性較海水中豐富,蝦樣品中副溶血性弧菌優勢譜型為Ⅱ類型.錶明不同樣品中副溶血性弧菌優勢型不同,進而推測不同類型譜型的菌株耐冷特性不同.
채용장세균기인외중복회문서렬확증(REP-PCR)화장도세균기인간중복서렬확증(ERIC-PCR)2충방법,대종3충불동양품중분리득도적부용혈성호균진행분형분석；통과REP화ERIC-PCR지문도보확증,이용NT-SYS-pc연건,병채용Dice계수대지문도보진행취류분석.결과현시:55주부용혈성호균REP-PCR지문도취보공분위3대류,기중저니중적우세보형위Ⅰ류형,해수중적우세보형위Ⅱ류형,하양품중적우세보형위Ⅰ류형；ERIC-PCR지문보형야취류위3대류,재해수화저니중적우세보형균위Ⅰ류형,단저니중부용혈성호균다양성교해수중봉부,하양품중부용혈성호균우세보형위Ⅱ류형.표명불동양품중부용혈성호균우세형불동,진이추측불동류형보형적균주내랭특성불동.
