CAJ | 학술논문

采用PCR技术对乌克兰鳞鲤Cyprinus carpio、鲫Carassis auratus、鲢Hypophthalmichthys molitrix、鳙Aritichthys nobilis、草鱼Ctenopharyngodon idellus和乌苏里拟鲿Pseudobagrus ussuriensis共28个个体(分属于天津市动植物抗性重点实验室应用PCR-RFLP方法已检测出的不同单倍型)的mtDNA D-loop及其邻近区段进行扩增并测序,获得了大小为1 500～1 800 bp的扩增产物.用Clustal 1.83软件与GenBank中的鲤、金鱼、鲢、草鱼、长吻鮠5种鱼的mtDNA全序列进行排序比较,确定扩增产物包含完整的tRNAPm、Dloop、tRNAPhe序列以及12S rRNA长度约为400 bp的部分序列.将6种鱼共28个样本的序列提交GenBank后获得序列号为KC292921～ KC292948.运用Mega 4.0软件计算出6种鱼的碱基组成和碱基差异,基于Kimura双参数模型计算种间的遗传距离,并与GenBank中5种鱼的mtDNA序列一起构建NJ系统树.序列结构分析表明,在6种鱼序列的4个区段中,D-loop区段在种内、种间的差异性均高于另外3个区段.6种鱼NJ系统树的结果与传统分类方法一致,可为鱼类分类以及种类鉴定提供科学依据.另外,6种鱼各种单倍型均在所测得序列中找到相应的酶切位点,印证了RFLP实验结果,在酶切位点以外也发现了同种鱼的不同单倍型间存在碱基差异.
채용PCR기술대오극란린리Cyprinus carpio、즉Carassis auratus、련Hypophthalmichthys molitrix、용Aritichthys nobilis、초어Ctenopharyngodon idellus화오소리의상Pseudobagrus ussuriensis공28개개체(분속우천진시동식물항성중점실험실응용PCR-RFLP방법이검측출적불동단배형)적mtDNA D-loop급기린근구단진행확증병측서,획득료대소위1 500～1 800 bp적확증산물.용Clustal 1.83연건여GenBank중적리、금어、련、초어、장문외5충어적mtDNA전서렬진행배서비교,학정확증산물포함완정적tRNAPm、Dloop、tRNAPhe서렬이급12S rRNA장도약위400 bp적부분서렬.장6충어공28개양본적서렬제교GenBank후획득서렬호위KC292921～ KC292948.운용Mega 4.0연건계산출6충어적감기조성화감기차이,기우Kimura쌍삼수모형계산충간적유전거리,병여GenBank중5충어적mtDNA서렬일기구건NJ계통수.서렬결구분석표명,재6충어서렬적4개구단중,D-loop구단재충내、충간적차이성균고우령외3개구단.6충어NJ계통수적결과여전통분류방법일치,가위어류분류이급충류감정제공과학의거.령외,6충어각충단배형균재소측득서렬중조도상응적매절위점,인증료RFLP실험결과,재매절위점이외야발현료동충어적불동단배형간존재감기차이.