生物安全学报
生物安全學報
생물안전학보
Journal of Biosafety
2012年
4期
308-314
,共7页
李俊%韩辉林%高强%金倩%迟美妍%武春生%张爱兵
李俊%韓輝林%高彊%金倩%遲美妍%武春生%張愛兵
리준%한휘림%고강%금천%지미연%무춘생%장애병
DNA条形码%夜蛾科%支持向量机%邻接法%近缘种
DNA條形碼%夜蛾科%支持嚮量機%鄰接法%近緣種
DNA조형마%야아과%지지향량궤%린접법%근연충
[背景]鳞翅目夜蛾科昆虫种类繁多,目前已经超过3.5万种,绝大多数是农林生产的主要害虫.由于多数近缘属种形态相似,难以鉴定,给农林害虫的防治工作带了很大的困难.DNA条形码技术是一种快速、准确鉴定物种的方法.支持向量机作为一种新的机器学习方法,自1995年被提出以来已经在数据分类和高维模式识别等领域取得不错的效果.[方法]将北京妙峰山采集的58种夜蛾101个样品的COI序列分成3套数据集,分别通过邻接法和支持向量机对其进行验证.[结果]通过对DNA条形码物种鉴定结果的验证表明,邻接法优于支持向量机.但DNA条形码在鉴定夜蛾科的一些近缘种上,效果不佳,如棉铃虫和烟青虫.[结论与意义]DNA条形码作为一种新兴的物种鉴定方法,在分类学上具有很高的应用价值.通过邻接法和支持向量机的比较,虽然支持向量机的成功率低于邻接法,但是其在DNA条形码中的应用是对数据问询方式的一种探索.
[揹景]鱗翅目夜蛾科昆蟲種類繁多,目前已經超過3.5萬種,絕大多數是農林生產的主要害蟲.由于多數近緣屬種形態相似,難以鑒定,給農林害蟲的防治工作帶瞭很大的睏難.DNA條形碼技術是一種快速、準確鑒定物種的方法.支持嚮量機作為一種新的機器學習方法,自1995年被提齣以來已經在數據分類和高維模式識彆等領域取得不錯的效果.[方法]將北京妙峰山採集的58種夜蛾101箇樣品的COI序列分成3套數據集,分彆通過鄰接法和支持嚮量機對其進行驗證.[結果]通過對DNA條形碼物種鑒定結果的驗證錶明,鄰接法優于支持嚮量機.但DNA條形碼在鑒定夜蛾科的一些近緣種上,效果不佳,如棉鈴蟲和煙青蟲.[結論與意義]DNA條形碼作為一種新興的物種鑒定方法,在分類學上具有很高的應用價值.通過鄰接法和支持嚮量機的比較,雖然支持嚮量機的成功率低于鄰接法,但是其在DNA條形碼中的應用是對數據問詢方式的一種探索.
[배경]린시목야아과곤충충류번다,목전이경초과3.5만충,절대다수시농림생산적주요해충.유우다수근연속충형태상사,난이감정,급농림해충적방치공작대료흔대적곤난.DNA조형마기술시일충쾌속、준학감정물충적방법.지지향량궤작위일충신적궤기학습방법,자1995년피제출이래이경재수거분류화고유모식식별등영역취득불착적효과.[방법]장북경묘봉산채집적58충야아101개양품적COI서렬분성3투수거집,분별통과린접법화지지향량궤대기진행험증.[결과]통과대DNA조형마물충감정결과적험증표명,린접법우우지지향량궤.단DNA조형마재감정야아과적일사근연충상,효과불가,여면령충화연청충.[결론여의의]DNA조형마작위일충신흥적물충감정방법,재분류학상구유흔고적응용개치.통과린접법화지지향량궤적비교,수연지지향량궤적성공솔저우린접법,단시기재DNA조형마중적응용시대수거문순방식적일충탐색.