广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
23期
142-145
,共4页
吴海锋%汤绮明%苏瑛%周松海%谭道杰%刘鸿%张丽%叶昌辉
吳海鋒%湯綺明%囌瑛%週鬆海%譚道傑%劉鴻%張麗%葉昌輝
오해봉%탕기명%소영%주송해%담도걸%류홍%장려%협창휘
PGC1-α%5'调控区%鸡%生物信息学
PGC1-α%5'調控區%鷄%生物信息學
PGC1-α%5'조공구%계%생물신식학
利用BLAST 、Neural Network Promoter Prediction 、ORF Finder、CpG Island Searcher和TF SEARCH等在线软件预测鸡的PGC1-α基因的5’调控区的启动子、开放阅读框、CpG岛及转录因子结合位点.结果显示,鸡与其他物种的PGC1-α核苷酸序列同源性很高,达84％以上;PGC1-α基因5’调控区序列上启动子可能位于1 900 bp处；评分在85分以上时,该区域具有221个潜在的转录因子结合位点；有12个潜在的转录因子结合位点评分在95分以上；最大ORF位于1 411～1 617位核苷酸,共编码69个氨基酸；CpG岛为200 bp区间(1900～2100 bp).
利用BLAST 、Neural Network Promoter Prediction 、ORF Finder、CpG Island Searcher和TF SEARCH等在線軟件預測鷄的PGC1-α基因的5’調控區的啟動子、開放閱讀框、CpG島及轉錄因子結閤位點.結果顯示,鷄與其他物種的PGC1-α覈苷痠序列同源性很高,達84％以上;PGC1-α基因5’調控區序列上啟動子可能位于1 900 bp處；評分在85分以上時,該區域具有221箇潛在的轉錄因子結閤位點；有12箇潛在的轉錄因子結閤位點評分在95分以上；最大ORF位于1 411～1 617位覈苷痠,共編碼69箇氨基痠；CpG島為200 bp區間(1900～2100 bp).
이용BLAST 、Neural Network Promoter Prediction 、ORF Finder、CpG Island Searcher화TF SEARCH등재선연건예측계적PGC1-α기인적5’조공구적계동자、개방열독광、CpG도급전록인자결합위점.결과현시,계여기타물충적PGC1-α핵감산서렬동원성흔고,체84％이상;PGC1-α기인5’조공구서렬상계동자가능위우1 900 bp처；평분재85분이상시,해구역구유221개잠재적전록인자결합위점；유12개잠재적전록인자결합위점평분재95분이상；최대ORF위우1 411～1 617위핵감산,공편마69개안기산；CpG도위200 bp구간(1900～2100 bp).
