棉花学报
棉花學報
면화학보
COTTON SCIENCE
2013年
1期
1-8
,共8页
巩元勇%郭书巧%束红梅%倪万潮
鞏元勇%郭書巧%束紅梅%倪萬潮
공원용%곽서교%속홍매%예만조
陆地棉%水通道蛋白%GhNIP6.1%表达序列标签
陸地棉%水通道蛋白%GhNIP6.1%錶達序列標籤
륙지면%수통도단백%GhNIP6.1%표체서렬표첨
根据EST拼接的序列设计引物,利用RT-PCR技术,从陆地棉品种苏棉18中克隆获得了一个水通道蛋白基因GhNIP6.1.该基因开放阅读框包含903个核苷酸,编码300个氨基酸,分子量为30.97 kD,理论等电点为8.99.GhNIP6.1蛋白的生物信息学分析表明:GhNIP6.1含有6个跨膜区,由5个环相连,其中环A、C和E在细胞膜外,环B、D和蛋白的N、C末端都位于细胞膜内,N末端79个氨基酸,C末端18个氨基酸,具有MIP家族典型的保守氨基酸序列；该蛋白的三级结构同拟南芥的AtNIP6.1非常相似,亚细胞定位也同AtNIP6.1一致,可能位于质膜中.进化分析发现,GhNIP6.1蛋白同拟南芥的AtNIP6.1蛋白相似性最高.进一步扩增棉花核基因组获得了2021bp的DNA序列,它包含5个外显子和4个内含子,所有外显子/内含子交接点都遵从gt/ag剪接规则.半定量分析表明,该基因在根、茎和叶中都有表达,其中真叶含量较高,子叶中没有表达.
根據EST拼接的序列設計引物,利用RT-PCR技術,從陸地棉品種囌棉18中剋隆穫得瞭一箇水通道蛋白基因GhNIP6.1.該基因開放閱讀框包含903箇覈苷痠,編碼300箇氨基痠,分子量為30.97 kD,理論等電點為8.99.GhNIP6.1蛋白的生物信息學分析錶明:GhNIP6.1含有6箇跨膜區,由5箇環相連,其中環A、C和E在細胞膜外,環B、D和蛋白的N、C末耑都位于細胞膜內,N末耑79箇氨基痠,C末耑18箇氨基痠,具有MIP傢族典型的保守氨基痠序列；該蛋白的三級結構同擬南芥的AtNIP6.1非常相似,亞細胞定位也同AtNIP6.1一緻,可能位于質膜中.進化分析髮現,GhNIP6.1蛋白同擬南芥的AtNIP6.1蛋白相似性最高.進一步擴增棉花覈基因組穫得瞭2021bp的DNA序列,它包含5箇外顯子和4箇內含子,所有外顯子/內含子交接點都遵從gt/ag剪接規則.半定量分析錶明,該基因在根、莖和葉中都有錶達,其中真葉含量較高,子葉中沒有錶達.
근거EST병접적서렬설계인물,이용RT-PCR기술,종륙지면품충소면18중극륭획득료일개수통도단백기인GhNIP6.1.해기인개방열독광포함903개핵감산,편마300개안기산,분자량위30.97 kD,이론등전점위8.99.GhNIP6.1단백적생물신식학분석표명:GhNIP6.1함유6개과막구,유5개배상련,기중배A、C화E재세포막외,배B、D화단백적N、C말단도위우세포막내,N말단79개안기산,C말단18개안기산,구유MIP가족전형적보수안기산서렬；해단백적삼급결구동의남개적AtNIP6.1비상상사,아세포정위야동AtNIP6.1일치,가능위우질막중.진화분석발현,GhNIP6.1단백동의남개적AtNIP6.1단백상사성최고.진일보확증면화핵기인조획득료2021bp적DNA서렬,타포함5개외현자화4개내함자,소유외현자/내함자교접점도준종gt/ag전접규칙.반정량분석표명,해기인재근、경화협중도유표체,기중진협함량교고,자협중몰유표체.
