集美大学学报(自然科学版)
集美大學學報(自然科學版)
집미대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF JIMEI UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2013年
1期
18-23
,共6页
嗜热菌%硫酸酯酶%基因%克隆%生物信息学
嗜熱菌%硫痠酯酶%基因%剋隆%生物信息學
기열균%류산지매%기인%극륭%생물신식학
利用筛选培养基筛选到一株产硫酸酯酶的深海嗜热菌EPT3,通过16S rDNA分析,将该菌株归属为Geobacillus sp.EPT3.以菌株EPT3的基因组DNA为模板,使用硫酸酯酶引物进行PCR扩增,将目的基因克隆至pUCm-T载体后进行测序.测序结果表明,克隆基因的大小为1956 bp,预测编码651个氨基酸残基.对该基因编码蛋白质进行了生物信息学分析,结果表明,该蛋白质序列与其他菌株来源的硫酸酯酶具有很高的相似性,提示本研究克隆的基因编码硫酸酯酶.该硫酸酯酶的理论分子质量为75.1 ku,理论等电点为6.90.采用同源建模法建立了Geobacillus sp.EPT3硫酸酯酶的三维结构模型,为球状结构.
利用篩選培養基篩選到一株產硫痠酯酶的深海嗜熱菌EPT3,通過16S rDNA分析,將該菌株歸屬為Geobacillus sp.EPT3.以菌株EPT3的基因組DNA為模闆,使用硫痠酯酶引物進行PCR擴增,將目的基因剋隆至pUCm-T載體後進行測序.測序結果錶明,剋隆基因的大小為1956 bp,預測編碼651箇氨基痠殘基.對該基因編碼蛋白質進行瞭生物信息學分析,結果錶明,該蛋白質序列與其他菌株來源的硫痠酯酶具有很高的相似性,提示本研究剋隆的基因編碼硫痠酯酶.該硫痠酯酶的理論分子質量為75.1 ku,理論等電點為6.90.採用同源建模法建立瞭Geobacillus sp.EPT3硫痠酯酶的三維結構模型,為毬狀結構.
이용사선배양기사선도일주산류산지매적심해기열균EPT3,통과16S rDNA분석,장해균주귀속위Geobacillus sp.EPT3.이균주EPT3적기인조DNA위모판,사용류산지매인물진행PCR확증,장목적기인극륭지pUCm-T재체후진행측서.측서결과표명,극륭기인적대소위1956 bp,예측편마651개안기산잔기.대해기인편마단백질진행료생물신식학분석,결과표명,해단백질서렬여기타균주래원적류산지매구유흔고적상사성,제시본연구극륭적기인편마류산지매.해류산지매적이론분자질량위75.1 ku,이론등전점위6.90.채용동원건모법건립료Geobacillus sp.EPT3류산지매적삼유결구모형,위구상결구.