湖南工业大学学报
湖南工業大學學報
호남공업대학학보
JOURNAL OF HUNAN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY
2012年
2期
10-15
,共6页
完全基因组%系统发育树%组合向量%对数关联距离%互信息距离%加权距离
完全基因組%繫統髮育樹%組閤嚮量%對數關聯距離%互信息距離%加權距離
완전기인조%계통발육수%조합향량%대수관련거리%호신식거리%가권거리
complete genomes%phylogenetic tree%composition vector%log-correlation distance%mutual information distance%weighted distance
应用对数关联距离与互信息距离加权的方法，对完全基因组DNA序列和蛋白质序列构建了30种细小病毒系统发育树。构建的发育树均将30种细小病毒分成细小病毒亚科和浓核病毒亚科两个大的分枝，其结构与国际病毒学分类委员会第八版报道的结果及已有文献的结果基本一致。且基于蛋白质序列构建的系统发育树比基于完全基因组DNA序列构建的要好。
應用對數關聯距離與互信息距離加權的方法，對完全基因組DNA序列和蛋白質序列構建瞭30種細小病毒繫統髮育樹。構建的髮育樹均將30種細小病毒分成細小病毒亞科和濃覈病毒亞科兩箇大的分枝，其結構與國際病毒學分類委員會第八版報道的結果及已有文獻的結果基本一緻。且基于蛋白質序列構建的繫統髮育樹比基于完全基因組DNA序列構建的要好。
응용대수관련거리여호신식거리가권적방법，대완전기인조DNA서렬화단백질서렬구건료30충세소병독계통발육수。구건적발육수균장30충세소병독분성세소병독아과화농핵병독아과량개대적분지，기결구여국제병독학분류위원회제팔판보도적결과급이유문헌적결과기본일치。차기우단백질서렬구건적계통발육수비기우완전기인조DNA서렬구건적요호。
The phylogenetic trees of 30 parvoviruses are reconstructed by the weighted methods of log-correlation distance and mutual information distance. The trees are made of two branches of parvovirinae and densovirinae, and the structures are mainly consistent with the eighth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses and results of the existing literature. The tree based on the protein sequences construction is better than that based on entire genome DNA sequences construction.
