生物加工过程
生物加工過程
생물가공과정
CHINESE JOURNAL OF BIOPROCESS ENGINEERING
2012年
6期
29-33
,共5页
汤晓芒%张鲁嘉%崔东冰%姚志强%王学东%魏东芝
湯曉芒%張魯嘉%崔東冰%姚誌彊%王學東%魏東芝
탕효망%장로가%최동빙%요지강%왕학동%위동지
同源建模%分子动力学%溶剂可接触性%腈水解酶%热稳定性
同源建模%分子動力學%溶劑可接觸性%腈水解酶%熱穩定性
동원건모%분자동역학%용제가접촉성%정수해매%열은정성
蛋白含带电侧链基团的氨基酸的位置对蛋白质的热稳定性有很大的影响,目前,往往采用蛋白质结构模型“静态”分析这一影响.本文以1株耐热的腈水解酶作为研究对象,构建并异源表达了该酶,对其酶学性质进行初步分析.利用Discovery Studio对该酶进行同源建模,得到空间结构.将此空间结构利用Gromacs软件在不同温度下进行分子动力学(MD)模拟,使用Macrodox软件计算蛋白质所有带电氨基酸残基的包埋率与溶剂可接触性面积(SA),发现在不同温度下,部分氨基酸带电基团的SA值会发生显著变化.说明通过静态分析并不一定能够得到非常准确的结果,而应进行动态分析.
蛋白含帶電側鏈基糰的氨基痠的位置對蛋白質的熱穩定性有很大的影響,目前,往往採用蛋白質結構模型“靜態”分析這一影響.本文以1株耐熱的腈水解酶作為研究對象,構建併異源錶達瞭該酶,對其酶學性質進行初步分析.利用Discovery Studio對該酶進行同源建模,得到空間結構.將此空間結構利用Gromacs軟件在不同溫度下進行分子動力學(MD)模擬,使用Macrodox軟件計算蛋白質所有帶電氨基痠殘基的包埋率與溶劑可接觸性麵積(SA),髮現在不同溫度下,部分氨基痠帶電基糰的SA值會髮生顯著變化.說明通過靜態分析併不一定能夠得到非常準確的結果,而應進行動態分析.
단백함대전측련기단적안기산적위치대단백질적열은정성유흔대적영향,목전,왕왕채용단백질결구모형“정태”분석저일영향.본문이1주내열적정수해매작위연구대상,구건병이원표체료해매,대기매학성질진행초보분석.이용Discovery Studio대해매진행동원건모,득도공간결구.장차공간결구이용Gromacs연건재불동온도하진행분자동역학(MD)모의,사용Macrodox연건계산단백질소유대전안기산잔기적포매솔여용제가접촉성면적(SA),발현재불동온도하,부분안기산대전기단적SA치회발생현저변화.설명통과정태분석병불일정능구득도비상준학적결과,이응진행동태분석.
