昆明医科大学学报
昆明醫科大學學報
곤명의과대학학보
Journal of Kunming Medical University
2012年
10期
4-9
,共6页
李华玲%陈文飞%陈欣虹%周晓霞%张成岗
李華玲%陳文飛%陳訢虹%週曉霞%張成崗
리화령%진문비%진흔홍%주효하%장성강
秀丽线虫%缺氧敏感株系(ia04)%蛋白质组学%热休克蛋白
秀麗線蟲%缺氧敏感株繫(ia04)%蛋白質組學%熱休剋蛋白
수려선충%결양민감주계(ia04)%단백질조학%열휴극단백
目的 研究秀丽线虫(Caenorhabditis elegans)野生株系N2和缺氧敏感株系(ia04)的差异蛋白质,为进行线虫在缺氧环境下的应答机制研究奠定基础.方法 同步化培养2种株系的线虫,培养至L4期时,常规方法提取总蛋白,采用双向电泳分离和串联质谱分析,搜索Swiss-Prot线虫数据库,鉴定蛋白种类并根据基因本体论(gene ontology,GO)进行分析.结果 质谱成功鉴定了其中的25个差异显著蛋白(ratio＞ 2.0,P＜0.05),其中N2株系检测到的表达量比ia04株系高的主要是热休克蛋白(HSP-70,HSP-60)、GTP结合蛋白(TAG-210)、乙酰辅酶A脱氢酶中链(GN=T)；ia04株系检测到的表达量比N2高的是延伸因子(EFT-3)和铁硫蛋白-1 (ISP-1),在ia04株系中,HSP的含量明显低于N2株系,说明这可能是ia04株系对缺氧敏感的原因之一.根据GO注释结果发现,鉴定到的这些差异蛋白与线虫的DNA合成及生长发育的相关性较大.结论 蛋白质组学的方法为线虫缺氧的研究提供了有参考价值的数据,不同株系差异蛋白的发现可促进对缺氧应答机制的了解,且可从蛋白质水平揭示重要表型的基因表达机制.
目的 研究秀麗線蟲(Caenorhabditis elegans)野生株繫N2和缺氧敏感株繫(ia04)的差異蛋白質,為進行線蟲在缺氧環境下的應答機製研究奠定基礎.方法 同步化培養2種株繫的線蟲,培養至L4期時,常規方法提取總蛋白,採用雙嚮電泳分離和串聯質譜分析,搜索Swiss-Prot線蟲數據庫,鑒定蛋白種類併根據基因本體論(gene ontology,GO)進行分析.結果 質譜成功鑒定瞭其中的25箇差異顯著蛋白(ratio＞ 2.0,P＜0.05),其中N2株繫檢測到的錶達量比ia04株繫高的主要是熱休剋蛋白(HSP-70,HSP-60)、GTP結閤蛋白(TAG-210)、乙酰輔酶A脫氫酶中鏈(GN=T)；ia04株繫檢測到的錶達量比N2高的是延伸因子(EFT-3)和鐵硫蛋白-1 (ISP-1),在ia04株繫中,HSP的含量明顯低于N2株繫,說明這可能是ia04株繫對缺氧敏感的原因之一.根據GO註釋結果髮現,鑒定到的這些差異蛋白與線蟲的DNA閤成及生長髮育的相關性較大.結論 蛋白質組學的方法為線蟲缺氧的研究提供瞭有參攷價值的數據,不同株繫差異蛋白的髮現可促進對缺氧應答機製的瞭解,且可從蛋白質水平揭示重要錶型的基因錶達機製.
목적 연구수려선충(Caenorhabditis elegans)야생주계N2화결양민감주계(ia04)적차이단백질,위진행선충재결양배경하적응답궤제연구전정기출.방법 동보화배양2충주계적선충,배양지L4기시,상규방법제취총단백,채용쌍향전영분리화천련질보분석,수색Swiss-Prot선충수거고,감정단백충류병근거기인본체론(gene ontology,GO)진행분석.결과 질보성공감정료기중적25개차이현저단백(ratio＞ 2.0,P＜0.05),기중N2주계검측도적표체량비ia04주계고적주요시열휴극단백(HSP-70,HSP-60)、GTP결합단백(TAG-210)、을선보매A탈경매중련(GN=T)；ia04주계검측도적표체량비N2고적시연신인자(EFT-3)화철류단백-1 (ISP-1),재ia04주계중,HSP적함량명현저우N2주계,설명저가능시ia04주계대결양민감적원인지일.근거GO주석결과발현,감정도적저사차이단백여선충적DNA합성급생장발육적상관성교대.결론 단백질조학적방법위선충결양적연구제공료유삼고개치적수거,불동주계차이단백적발현가촉진대결양응답궤제적료해,차가종단백질수평게시중요표형적기인표체궤제.
