农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2012年
12期
1369-1377
,共9页
李伟忠%姚希勤%许崇香%闵丽%陈庆山%胡国华
李偉忠%姚希勤%許崇香%閔麗%陳慶山%鬍國華
리위충%요희근%허숭향%민려%진경산%호국화
玉米%SSR%关联分析%连锁不平衡%群体结构
玉米%SSR%關聯分析%連鎖不平衡%群體結構
옥미%SSR%관련분석%련쇄불평형%군체결구
为寻找并确定控制玉米产量、品质的基因组区域,本研究利用64对核心SSR(simple sequence repeats)标记对257份玉米(Zea mays L.)自交系构成的群体进行基因分型,分析群体连锁不平衡位点、群体结构,在此基础上,采用TASSEL软件的GLM(general linear mode)程序对株高、穗位、生育期、穗长、穗行数、百粒重、脂肪含量、蛋白质含量和淀粉含量共9个性状的表型数据与标记进行回归分析,确定标记对表型的解释率.结果表明:(1)在公共图谱上的SSR位点组合都有一定程度连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD),P<0.01时,LD成对位点占总位点组合20.29%,D’>0.5成对位点比例为12.65%.(2)SSR数据遗传结构分析表明,群体可分为5个亚群.(3)共鉴定出26个标记位点与9个性状相关联,大多集中在4、6、7和10染色体上,其中第7染色体上标记最多,为5个.8个位点的变异分别与株高、穗位、生育期、穗长、穗行数和蛋白质含量等6个表型性状极显著相关(P<0.01),分别为umc1294作用于株高,对表型的解释率为7.2%;umc1741及phil 16作用于穗位,对表型的解释率为11.37%和8.57%; phi328175及phi260485作用于生育期,对表型的解释率为4.74%和5.6%; umc1741作用于穗长,对表型的解释率为5.77%;umc1309作用于穗行数,对表型的解释率为6.68%; bnlg1450及bnlg1185作用于蛋白质含量,对表型的解释率为9.41%和9.81%;其他18个标记与9个性状显著相关(P<0.05).与单个性状关联的标记数目为1~7个,解释率为4.74%~14.31%.与产量相关性状关联的位点(次)累计为30个,与品质相关性状关联的位点(次)累计为7个,位点数目上品质性状远少于产量性状.部分标记与多个性状关联,可能是性状相关或一因多效的遗传基础,一些标记同时与某性状关联,多数标记与定位于遗传图谱的QTL(quantitative trait loci)一致,也有互补性.研究结果表明,这些位点及其区域内存在很多与产量、品质等性状相关的QTL,对提高玉米产量、改善玉米品质可能起到重要作用.
為尋找併確定控製玉米產量、品質的基因組區域,本研究利用64對覈心SSR(simple sequence repeats)標記對257份玉米(Zea mays L.)自交繫構成的群體進行基因分型,分析群體連鎖不平衡位點、群體結構,在此基礎上,採用TASSEL軟件的GLM(general linear mode)程序對株高、穗位、生育期、穗長、穗行數、百粒重、脂肪含量、蛋白質含量和澱粉含量共9箇性狀的錶型數據與標記進行迴歸分析,確定標記對錶型的解釋率.結果錶明:(1)在公共圖譜上的SSR位點組閤都有一定程度連鎖不平衡(linkage disequilibrium,LD),P<0.01時,LD成對位點佔總位點組閤20.29%,D’>0.5成對位點比例為12.65%.(2)SSR數據遺傳結構分析錶明,群體可分為5箇亞群.(3)共鑒定齣26箇標記位點與9箇性狀相關聯,大多集中在4、6、7和10染色體上,其中第7染色體上標記最多,為5箇.8箇位點的變異分彆與株高、穗位、生育期、穗長、穗行數和蛋白質含量等6箇錶型性狀極顯著相關(P<0.01),分彆為umc1294作用于株高,對錶型的解釋率為7.2%;umc1741及phil 16作用于穗位,對錶型的解釋率為11.37%和8.57%; phi328175及phi260485作用于生育期,對錶型的解釋率為4.74%和5.6%; umc1741作用于穗長,對錶型的解釋率為5.77%;umc1309作用于穗行數,對錶型的解釋率為6.68%; bnlg1450及bnlg1185作用于蛋白質含量,對錶型的解釋率為9.41%和9.81%;其他18箇標記與9箇性狀顯著相關(P<0.05).與單箇性狀關聯的標記數目為1~7箇,解釋率為4.74%~14.31%.與產量相關性狀關聯的位點(次)纍計為30箇,與品質相關性狀關聯的位點(次)纍計為7箇,位點數目上品質性狀遠少于產量性狀.部分標記與多箇性狀關聯,可能是性狀相關或一因多效的遺傳基礎,一些標記同時與某性狀關聯,多數標記與定位于遺傳圖譜的QTL(quantitative trait loci)一緻,也有互補性.研究結果錶明,這些位點及其區域內存在很多與產量、品質等性狀相關的QTL,對提高玉米產量、改善玉米品質可能起到重要作用.
위심조병학정공제옥미산량、품질적기인조구역,본연구이용64대핵심SSR(simple sequence repeats)표기대257빈옥미(Zea mays L.)자교계구성적군체진행기인분형,분석군체련쇄불평형위점、군체결구,재차기출상,채용TASSEL연건적GLM(general linear mode)정서대주고、수위、생육기、수장、수행수、백립중、지방함량、단백질함량화정분함량공9개성상적표형수거여표기진행회귀분석,학정표기대표형적해석솔.결과표명:(1)재공공도보상적SSR위점조합도유일정정도련쇄불평형(linkage disequilibrium,LD),P<0.01시,LD성대위점점총위점조합20.29%,D’>0.5성대위점비례위12.65%.(2)SSR수거유전결구분석표명,군체가분위5개아군.(3)공감정출26개표기위점여9개성상상관련,대다집중재4、6、7화10염색체상,기중제7염색체상표기최다,위5개.8개위점적변이분별여주고、수위、생육기、수장、수행수화단백질함량등6개표형성상겁현저상관(P<0.01),분별위umc1294작용우주고,대표형적해석솔위7.2%;umc1741급phil 16작용우수위,대표형적해석솔위11.37%화8.57%; phi328175급phi260485작용우생육기,대표형적해석솔위4.74%화5.6%; umc1741작용우수장,대표형적해석솔위5.77%;umc1309작용우수행수,대표형적해석솔위6.68%; bnlg1450급bnlg1185작용우단백질함량,대표형적해석솔위9.41%화9.81%;기타18개표기여9개성상현저상관(P<0.05).여단개성상관련적표기수목위1~7개,해석솔위4.74%~14.31%.여산량상관성상관련적위점(차)루계위30개,여품질상관성상관련적위점(차)루계위7개,위점수목상품질성상원소우산량성상.부분표기여다개성상관련,가능시성상상관혹일인다효적유전기출,일사표기동시여모성상관련,다수표기여정위우유전도보적QTL(quantitative trait loci)일치,야유호보성.연구결과표명,저사위점급기구역내존재흔다여산량、품질등성상상관적QTL,대제고옥미산량、개선옥미품질가능기도중요작용.