华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2012年
z1期
1-5
,共5页
李孟军%高欣娜%傅晓艺%史占良%郭进考
李孟軍%高訢娜%傅曉藝%史佔良%郭進攷
리맹군%고흔나%부효예%사점량%곽진고
小麦%高亲和性钾转运蛋白%启动子
小麥%高親和性鉀轉運蛋白%啟動子
소맥%고친화성갑전운단백%계동자
根据普通小麦HKT1 cDNA序列(GenBank登录号:U16709)设计基因特异引物,通过筛选矮败中国春BAC文库,获得含有HKT1基因组序列单克隆BAC.根据HKT1 5'-端已知序列设计测序引物,以单克隆BAC质粒为模板进行测序,序列经Sequencer软件拼接,获得了HKT1基因起始密码子上游4 192 bp序列.用Neural Network Promoter Prediction(NNPP)软件分析此序列,预测存在9个转录起始点.PLACE软件分析表明,该序列具有启动子的基本元件TATA-box、CAAT-box,包含多个胁迫诱导元件,如盐诱导元件GAAAAA,抗冻、缺水、脱落酸、抗寒元件CANNTG和CCGAC等,伤害诱导元件TGACY,组织特异表达元件ACTTTA和ATATT等.HKT1启动子克隆表明,设计基因特异引物筛选BAC文库,通过以单克隆BAC质粒为模板直接测序获得基因启动子序列的方法是从普通小麦基因组中克隆基因启动子的一条切实可行的途径.
根據普通小麥HKT1 cDNA序列(GenBank登錄號:U16709)設計基因特異引物,通過篩選矮敗中國春BAC文庫,穫得含有HKT1基因組序列單剋隆BAC.根據HKT1 5'-耑已知序列設計測序引物,以單剋隆BAC質粒為模闆進行測序,序列經Sequencer軟件拼接,穫得瞭HKT1基因起始密碼子上遊4 192 bp序列.用Neural Network Promoter Prediction(NNPP)軟件分析此序列,預測存在9箇轉錄起始點.PLACE軟件分析錶明,該序列具有啟動子的基本元件TATA-box、CAAT-box,包含多箇脅迫誘導元件,如鹽誘導元件GAAAAA,抗凍、缺水、脫落痠、抗寒元件CANNTG和CCGAC等,傷害誘導元件TGACY,組織特異錶達元件ACTTTA和ATATT等.HKT1啟動子剋隆錶明,設計基因特異引物篩選BAC文庫,通過以單剋隆BAC質粒為模闆直接測序穫得基因啟動子序列的方法是從普通小麥基因組中剋隆基因啟動子的一條切實可行的途徑.
근거보통소맥HKT1 cDNA서렬(GenBank등록호:U16709)설계기인특이인물,통과사선왜패중국춘BAC문고,획득함유HKT1기인조서렬단극륭BAC.근거HKT1 5'-단이지서렬설계측서인물,이단극륭BAC질립위모판진행측서,서렬경Sequencer연건병접,획득료HKT1기인기시밀마자상유4 192 bp서렬.용Neural Network Promoter Prediction(NNPP)연건분석차서렬,예측존재9개전록기시점.PLACE연건분석표명,해서렬구유계동자적기본원건TATA-box、CAAT-box,포함다개협박유도원건,여염유도원건GAAAAA,항동、결수、탈락산、항한원건CANNTG화CCGAC등,상해유도원건TGACY,조직특이표체원건ACTTTA화ATATT등.HKT1계동자극륭표명,설계기인특이인물사선BAC문고,통과이단극륭BAC질립위모판직접측서획득기인계동자서렬적방법시종보통소맥기인조중극륭기인계동자적일조절실가행적도경.